Equipa do DI vence competição internacional em "Ontology Matching"

OAEI
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Uma equipa do Departamento de Informática (DI) de Ciências vence competição internacional em correspondência de ontologias.

O Ontology Alignment Evaluation Initiative (OAEI) é uma competição internacional, iniciada em 2005, e que visa avaliar ferramentas de emparelhamento de ontologias.

O projeto SOMER, aprovado em 2012 e financiado pela Fundação para a Ciência e a Tecnologia, possibilitou o desenvolvimento do sistema AML - AgreementMakerLight -, derivado do AgreementMaker, uma plataforma amplamente utilizada em emparelhamento de ontologias desenvolvido pelos colaboradores do Laboratório de Isabel F. Cruz.

Nos últimos anos, a equipa do LASIGE tem desenvolvido aplicações que exploram os dados e conhecimento contido em ontologias. Este grupo especializou-se em prospeção de texto biomédico e medidas de semelhança semântica.

No âmbito do projeto SOMER, o grupo de Ciências, coordenado elo professor do DI, Francisco M. Couto, participou no OAEI 2013 e no OAEI 2014, tendo alcançado este ano o primeiro lugar em todas as tarefas para as quais o AML tinha sido desenvolvido.

Existe também uma colaboração com a Janssen Pharmaceutical Companies of Johnson & Johnson que ficou muito agradada com a possibilidade de usar o AML na gestão dos seus dados. Neste Momento o AML está também a ser explorado para um projeto no âmbito da Food and Agriculture Organization of the United Nations.

“A equipa desenvolveu o sistema AML para competir em seis tarefas (das nove no total), e em todas essas seis ficou em 1.º lugar! Um agradecimento especial ao Daniel Faria por ter passado todo o agosto nisto e a toda a equipa de Ciências envolvida - Cátia Pesquita, Emanuel Santos e Catarina Martins, sem esquecer todo o apoio da equipa de Isabel Cruz, professora da Universidade de Illinois, em Chicago.”
Francisco M. Couto

 

Sobre a perfomance AML

"AML was a step ahead and obtained the best average Recall and F-Measure, and the second best average Precision."

"The biggest improvement in F-measure, as well as the best overall result is achieved by AML, which increases its F-measure by seven percentage points."

"AML* has a better F-Measure than any other system before (4% increase compared to the best matcher of last year)."

"Same as the last year, the AML system set the top result for the anatomy track by improving the result from the last year."

"AML has similar results both in terms of precision and recall and outperforms the other systems in terms of F-measure (for both cases)."

"Tools are ordered according to their highest average F1-measure." (AML in the 1st place).

Notícia atualizada a 27/10/2014

DI com GCIC

A descoberta da localização precisa de uma espécie de GPS (Global Positioning System) no nosso cérebro (Moser e Moser, 2014), capaz de nos ajudar a responder a duas perguntas básicas “Onde estamos?” e “Como vamos até acolá?”, indispensáveis para a nossa vida normal, estimulou a discussão do tema computação espacial (ler a revista norte americana Communications Of the ACM, janeiro de 2016, páginas 72-81).

Joaquim Alves Gaspar, de 67 anos, investigador pós-doutoral do Centro Interuniversitário de História das Ciências e da Tecnologia, acaba de ser distinguido com uma Starting Grant do Conselho Europeu de Investigação, a primeira a ser atribuída a um membro da Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa. Em entrevista a Ciências apresenta o projeto “The Medieval and Early Modern Nautical Chart: Birth, Evolution and Use” alvo desta distinção, no valor de 1,2 milhões de euros, bem como o homem que pretende causar um impacto significativo na História da Cartografia, demonstrando a eficácia das suas ferramentas e ajudando a criar uma nova geração de cientistas nesta área.

O Conselho Europeu de Investigação atribuiu uma Starting Grant, no valor de 1,2 milhões de euros, a Joaquim Alves Gaspar, membro integrado do Centro Interuniversitário de História das Ciências e da Tecnologia (CIUHCT) e investigador principal do projeto “The Medieval and Early Modern Nautical Chart: Birth, Evolution and Use”.

"No momento atual o alerta de potencial erupção ainda não terminou uma vez que a atividade sísmica se mantém acima dos valores normais", escreve José Madeira em mais uma crónica de viagem.

"Comunicar significa tornar comum. E o que queremos tornar comum? Ciência. Esse é o objetivo", escreve em artigo de opinião Manuel Leite Valença.

César Garcia, curador convidado do Museu Nacional de História Natural da Universidade de Lisboa, investigador do cE3c e antigo aluno de Ciências, é o autor de uma das fotografias premiadas, escolha do editor, no âmbito da 4.ª edição do BMC Ecology Image Competition, uma iniciativa da BioMed Central.

A equipa da UNDAC (United Nations Disaster Assessment and Coordination)/ERCC (European Response Coordination Centre) da Comissão Europeia (CE) tem feito avaliação dos planos de emergência existentes e suas lacunas ou melhoramentos necessários, bem como reuniões com os principais agentes intervenientes a nível local em caso de catástrofe ou emergência.

Cerca de 60 alunos da EB1 S. João de Brito,  Agrupamento de Escolas de Alvalade, visitaram em julho passado o Departamento de Biologia Animal de Ciências.

Desde a chegada da equipa UNDAC/ERCC a sismicidade tem-se mantido em níveis estáveis após dois dias iniciais em que se tinha tornado progressivamente mais superficial (1 km abaixo do nível do mar).

O que fazem e o que pensam alguns membros da comunidade de Ciências? O oitavo Dictum et factum é com Vera Lopes, técnica superior do Departamento de Geologia de Ciências.

Os vencedores do galardão desenvolveram o melhor projeto de Net Zero Energy House.

Há espírito empreendedor nos corredores de Ciências e a prová-lo esteve a prestação dos alunos de Ciências e do ISCTE-IUL na Sessão Final da Disciplina de Projeto Empresarial.

Cerca de 14 alunos do ensino secundário decidiram passar uma semana das suas férias a frequentar a Escola de Verão de Energia, organizada pelos professores e alunos do mestrado integrado de Engenharia da Energia e do Ambiente, e que já vai na sua segunda edição.

Pedro Veiga, Luís Correia e Teresa Chambel, professores do Departamento de Informática (DI) de Ciências, participaram no primeiro E-Tech Portugal, ocorrido no início de junho de 2016, em Setúbal.

A racionalidade (homem racional) é inalcançável, porque a escolha ótima (identificada a maior parte das vezes com a utilidade máxima individual) é demasiado perfeita.

De acordo com o comunicado de imprensa emitido pela faculdade esta segunda-feira, para os investigadores a identificação de novos alvos moleculares é essencial para definir estratégias terapêuticas cada vez mais robustas nos doentes com fibrose quística. Entrevista com Carlos Farinha.

Participantes no laboratório

“A Química e os segredos de um chocolate perfeito”, “Olhando os átomos”, “A diversidade escondida dos oceanos: do microscópio ao DNA” e “As bactérias e a resistência a antibióticos” são só alguns exemplos dos projetos disponíveis no âmbito do

A Galeria Ciências é um espaço recente, dinâmico, polivalente, com grandes potencialidades.

José Pica

O que fazem e o que pensam alguns membros da comunidade de Ciências? O sétimo Dictum et factum é com José Pica, assistente técnico do Departamento de Biologia Vegetal de Ciências.

Crónica de Fernando Barriga e Sofia Martins, investigadores do IDL Ciências, em missão oceanográfica no Atlântico - TAG hydrothermal field.

A 2.ª corrida de carros solares tripulados em Portugal ocorre este sábado, 9 de julho de 2016, entre as 10h00 e as 14h00, no campus da Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa.

Gerson Miguel da Silva Lobo, estudante do 2.º ano do mestrado de Bioquímica, faleceu a 26 de junho de 2016. A Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa lamenta o triste acontecimento, apresentando as condolências aos familiares, amigos e colegas do Gerson Lobo.

A gestão das preferências tornou-se numa facilidade ao dispor do projetista e do programador, e o planeamento (relacionado com as ações ao longo do tempo) é capaz de transformar um problema como se de otimização se tratasse, sujeito a restrições, a objetivos múltiplos e a efeitos probabilísticos das ações.

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Galopim de Carvalho, um dos geólogos mais famosos de Portugal, natural de Évora, com quase 85 anos, regressa à Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa no próximo dia 27 de junho.

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