Seminário

Modelling spatially correlated time to infection data. Case studies in Malaria and Mastitis

Sala 6.4.30, FCUL, Lisboa

Por Luc Duchateau ​(Ghent University, Belgium).

Abstract: Time to infection data are often spatially correlated. We investigate existing and develope new modelling techniques for such data.

A first case study comprises a large time to malaria database containing more than 2,000 children that were followed up for a malaria event for two years in the Gilgel Gibe region of Ethiopia (Delenasaw et al., 2013). The children are clustered in 16 villages. A major covariate of interest is the distance of the household of the child to the hydro-electric dam as the dam itself might be a risk factor providing rich breeding grounds for the Anopheles mosquito which transmits the malaria parasite Plasmodium. A typical feature of this dataset is that the distance covariate is strongly correlated with the clustering covariate, i.e., children that live in a village far away from the dam all live far away from the dam. We demonstrate that the conditional frailty model (Duchateau and Janssen, 2008) can lead to bizarre results. Furthermore, we demonstrate the equivalence between the frailty model and the mixed Poisson regression model when certain conditions are met (Getachew et al., 2013).

The second case study constitutes quadruples of correlated infection times, i.e., the four udder quarters of the cow. Each udder quarter is isolated from the other ones and might thus be infected with the other quarters healthy. Different correlation structures are used to describe the dependence between the four udder quarters, based both on correlated frailty models using the Stochastic Approximation MCMC technique in the EM framework to estimate the parameters (Kuhn et al., 2016), and also on extensions of the Archimedean copula models that are based on the marginal survival functions (Prenen et al., 2018).

The expectation that the correlation between front (rear) udder quarter infection times is larger than between a front and a rear udder quarter is confirmed by our models.

14h30
CEAUL - Centro de Estatística e Aplicações da Universidade de Lisboa

RSS Meetup, por Nuno Lopes (IST, ULisboa).

Seminário do Departamento de Física de Ciências ULisboa, por Henrique Leitão (DHFC-FCUL, PI RUTTER ERC AdG).

Logótipo do evento

No dia 04 de abril, pelas 14h30, será gravado um episódio em direto do podcast "A Escala do Clima" de Filipe Duarte Santos (Professor Jubilado de CIÊNCIAS).

Fotografia de aluna

Uma iniciativa aberta a toda a comunidade académica da ULisboa.

Fotografia de coleção de insetos

The course includes several case studies of insect adaptation, and the most recent overview on insect evodevo, plasticity, ecophysiological responses and conservation under global change.

Título/data/local do evento e fotografia aérea de vias urbanas

Conferência da redeMOV, por Gabriel Costa Valença.

Logótipo CIE

A leading venue for presenting and discussing the latest research, industrial practice and innovations in dependable and secure computing.

Logótipos do evento/Ciências ULisboa/AEFCL e data do evento, sobre fotografia de edição anterior

O maior evento de empregabilidade de CIÊNCIAS, a decorrer nos dias 08 e 09 de abril.

Seminário do Centro de Física Teórica e Computacional, por João Neves (CFTC).

RSS Meetup, por Rodrigo Bruno (IST, ULisboa).

Título do evento

A collaborative initiative supported by five Portuguese research centers, aimed at strengthening and connecting the geometry research community in Portugal.

Equipa da Raiz Vertical Farms

Uma Experiência Única sobre Agricultura Urbana e Energia Renovável.

Título/data/local do evento e fotografia da cidade de Lisboa

The conference aims to bring together students and young researchers working in Mathematics, Statistics, and Applications with a view to fostering discussions and collaborations amongst participants.

Seminário do Instituto de Astrofísica e Ciências do Espaço, por Amidou Sorgho (Instituto de Astrofísica de Andalucía - IAA-CSIC, Spain).

Título "Para um ensino humanista das ciências" e logótipos das entidades organizadoras

O evento tem como tema principal "Para um ensino humanista das ciências" e conta com a participação de vários professores de CIÊNCIAS.

Microplásticos em suspensão no oceano

O curso tem como objetivo dar formação sobre a problemática da contaminação por detritos de plástico dos nossos ecossistemas, bem como alertar para os potenciais efeitos deletérios nos organismos - candidaturas até 22 de março.

Banner do Dia de Ciências 2025

A 29 de abril assinalamos o 114.º aniversário de CIÊNCIAS.

Junte-se a nós no Grande Auditório de CIÊNCIAS para uma tarde de celebração que reúne toda a comunidade da Faculdade.

Fotografia de fábrica a emitir poluição para a atmosfera

The course aims at enabling the participants to use different methods to measure the impacts of pollutants on ecosystems.

Logótipo C-Academy

O curso oferece uma base sólida sobre os fundamentos e práticas essenciais para proteger sistemas e dados num mundo cada vez mais digital - candidaturas até 13 de abril.

Banner Dia Aberto de CIÊNCIAS 2025.

Bem-vindos a Ciências ULisboa!

Um concurso de programação dirigido aos alunos do ensino secundário (11.º e 12.º anos), que visa promover a prática e o gosto pela programação.

Fotografia de Chapim-azul

The goal of this course is to provide the participants with the most recent and practical knowledge on the use of Functional Diversity.

Mão a segurar em globo de vidro

Curso acreditado pelo CCPFC para efeitos de progressão na carreira dos professores na dimensão cientifico-pedagógica dos grupos 230, 420, 510, 520 e 560, com candidaturas até 30 de abril.

Título/data/local do evento, logótipos das entidades organizadoras e fotografia de peixe

The event aims to facilitate the exchange of information and knowledge among professionals to advance the understanding, collaboration and capabilities of aquaculture to respond to the impact of climate change in a rapidly changing global environment.

Uma oportunidade única para interagir com a comunidade global de computação científica, com inscrições (preço reduzido) até 02 de maio.

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