Data Science Seminars

Machine learning-based protein design for bioengineering gene therapy vectors

Sala 6.3.27, Ciências ULisboa

Por Ana Filipa Rodrigues (LASIGE).

Machine learning (ML) transformed protein design, offering unprecedented opportunities to accelerate and refine the development of bioengineered proteins. Building on the latest advancements in this area, researchers are extending these innovations to therapeutic viral particles, focusing on viral vectors for gene therapy. The precise design and bioengineering of viral particles hold immense potential not only to advance the field of virus-based therapeutics, such as viral gene therapy, but also to foster discoveries in virology, including uncovering virus-host interactions and developing better vaccines and antivirals.

In ML-based protein design, models are trained on protein sequence data to learn the complex relationship between amino acid sequences and their corresponding effects on protein function. These models learn to navigate the sequence-to-function fitness landscape, enabling the prediction and the design of novel proteins with specific characteristics. This seminar will cover the core methodologies in ML-guided protein design, emphasizing key concepts, models, and applications. It will also explore how these advancements are being leveraged in the bioengineering of viral vectors, focusing on our ongoing research on designing new adeno-associated viral vectors (AAVs) for human gene therapy.

Short bio: Ana Filipa Rodrigues holds a Ph.D. in Biotechnology (2014) from NOVA University Lisbon and the University of Minnesota (USA). Her early research focused on improving viral vector production for human gene therapy using functional genomics and genetic engineering. In her post-doctoral research at the Experimental Virology Department of Hannover Medical School/TWINCORE (Germany), she studied virus-host interactions to aid the development of antiviral therapies and vaccines.

In recent years, Filipa has worked at the intersection of academic research and the biopharmaceutical industry, specializing in cell and gene therapy, viral vaccines, molecular biology, and bioprocess engineering. She has recently joined the LASIGE Research Centre for Computer Science and Engineering at the University of Lisbon, where she applies machine learning to design and bioengineer therapeutic viral particles.

14h30
Mão a segurar em globo de vidro

Curso acreditado pelo CCPFC para efeitos de progressão na carreira dos professores na dimensão cientifico-pedagógica dos grupos 230, 420, 510, 520 e 560, com candidaturas até 30 de abril.

Seminário de Lógica Matemática, por Eduardo Magalhães (Universidade do Porto).

The aim of this event is to illustrate the importance of interdisciplinarity. To do so the meeting will bring together researchers from different areas who work in interdisciplinary fields within Ciências ULisboa

Seminário do Departamento de Física de Ciências ULisboa, por José Manuel Rebordão (FCUL - DF).

Seminário de Geometria e Física, por Tomás Inácio (FCUL, Universidade de Lisboa).

Cardume

Seminário Doutoral I (Doutoramento em Biologia), por Eduardo Miguel Onofre Feijão.

“Coroa de Flores” cósmica

Seminário do Instituto de Astrofísica e Ciências do Espaço, por Federica Loiacono (INAF OAS Bologna, Italy).

Seminário de Análise e Equações Diferenciais, por João Pedro Ramos (Instituto Nacional de Matemática Pura e Aplicada).

Logótipo do LIP Summer Internship Program

Um programa destinado a estudantes de Física e Engenharia com interesse em investigação científica e tecnológica, com candidaturas até 15 de maio (nova data).

O Museu Nacional de História Natural e da Ciência da Universidade de Lisboa celebra a Noite Europeia dos Museus (17 de maio) e o Dia Internacional dos Museus (18 de maio). Nestes dias, os Museus abrem as portas e convidam os cidadãos a conhecer os seus acervos, coleções, exposições e atividades.

Bodião-limpador "em ação"

Seminário Doutoral II (Doutoramento em Biologia), por Beatriz Palinhos Pereira.

Seminário do Centro de Física Teórica e Computacional, por João Amaral (Department of Physics and CICECO, University of Aveiro, Portugal).

Seminário de Análise e Equações Diferenciais, por Wladimir Neves (Universidade Federal do Rio de Janeiro).

Título/data/local do evento, logótipos das entidades organizadoras e fotografia de peixe

The event aims to facilitate the exchange of information and knowledge among professionals to advance the understanding, collaboration and capabilities of aquaculture to respond to the impact of climate change in a rapidly changing global environment.

Composição do logótipo da ULisboa e de representação do rosto humano à base de relógios

22 de maio - dois dos doze finalistas da competição são alunos de CIÊNCIAS.

Pintura abstrata azul e rosa

Seminário de Análise e Equações Diferenciais, por Leonid Berlyand (Penn State University).

Seminário do Instituto de Astrofísica e Ciências do Espaço, por Pier-Stefano Corasaniti (Observatoire de Paris-Meudon, France).

Logótipo do EVM 2025

Candidaturas até 28 de maio.

Uma oportunidade única para interagir com a comunidade global de computação científica.

Logótipo Moodle

Ação de formação para docentes e investigadores de CIÊNCIAS.

Título/data/local do evento e iconografia representativa de energias renováveis

Inscrições até 16 de maio! Junta-te a esta revolução energética e faz a diferença!

Logótipo Mentimeter

Ação de formação para docentes e investigadores de CIÊNCIAS.

Neste curso ficarás a saber como te podes tornar um permacultor eficiente, produtivo e consciente! O curso está preparado para iniciantes na prática de permacultura.

Formação - Cultivar em Permacultura.

Pessoas a interagirem em frente a um computador portátil

As inscrições para a edição de 2025 da formação decorrem até às 17h do dia 23 de maio.

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