Data Science Seminars

Machine learning-based protein design for bioengineering gene therapy vectors

Sala 6.3.27, Ciências ULisboa

Por Ana Filipa Rodrigues (LASIGE).

Machine learning (ML) transformed protein design, offering unprecedented opportunities to accelerate and refine the development of bioengineered proteins. Building on the latest advancements in this area, researchers are extending these innovations to therapeutic viral particles, focusing on viral vectors for gene therapy. The precise design and bioengineering of viral particles hold immense potential not only to advance the field of virus-based therapeutics, such as viral gene therapy, but also to foster discoveries in virology, including uncovering virus-host interactions and developing better vaccines and antivirals.

In ML-based protein design, models are trained on protein sequence data to learn the complex relationship between amino acid sequences and their corresponding effects on protein function. These models learn to navigate the sequence-to-function fitness landscape, enabling the prediction and the design of novel proteins with specific characteristics. This seminar will cover the core methodologies in ML-guided protein design, emphasizing key concepts, models, and applications. It will also explore how these advancements are being leveraged in the bioengineering of viral vectors, focusing on our ongoing research on designing new adeno-associated viral vectors (AAVs) for human gene therapy.

Short bio: Ana Filipa Rodrigues holds a Ph.D. in Biotechnology (2014) from NOVA University Lisbon and the University of Minnesota (USA). Her early research focused on improving viral vector production for human gene therapy using functional genomics and genetic engineering. In her post-doctoral research at the Experimental Virology Department of Hannover Medical School/TWINCORE (Germany), she studied virus-host interactions to aid the development of antiviral therapies and vaccines.

In recent years, Filipa has worked at the intersection of academic research and the biopharmaceutical industry, specializing in cell and gene therapy, viral vaccines, molecular biology, and bioprocess engineering. She has recently joined the LASIGE Research Centre for Computer Science and Engineering at the University of Lisbon, where she applies machine learning to design and bioengineer therapeutic viral particles.

14h30

Uma oportunidade única para interagir com a comunidade global de computação científica.

Seminário do Centro de Física Teórica e Computacional, por Pablo Sartori (Instituto Gulbenkian de Ciência, Oeiras, Portugal).

Mar

Seminário de Projeto de Investigação (Doutoramento em Biologia - Especialidade de Biologia Marinha e Aquacultura), por  João Noronha Gamito Trigo de Sousa.

Fotografia do stand da Imprensa da ULisboa

A 95.ª Feira do Livro de Lisboa decorre de 04 a 22 de junho.

Copilot Chat

Nesta sessão, serão exploradas as funcionalidades e benefícios do Microsoft 365 Copilot Chat de forma personalizada à comunidade académica de CIÊNCIAS.

Seminário de Lógica Matemática, por Duarte Maia (University of Chicago).

Logótipo Moodle

Ação de formação para docentes e investigadores de CIÊNCIAS.

Logótipo Mentimeter

Ação de formação para docentes e investigadores de CIÊNCIAS.

Título/data/local do evento e iconografia representativa de energias renováveis

Junta-te a esta revolução energética e faz a diferença!

Luís Saraiva (Ciências ULisboa) é o coordenador nacional do evento.

Fotografia de alimentos

Comemoração do Dia Mundial da Segurança dos Alimentos em CIÊNCIAS.

Neste curso ficarás a saber como te podes tornar um permacultor eficiente, produtivo e consciente! O curso está preparado para iniciantes na prática de permacultura.

Formação - Cultivar em Permacultura.

Pessoas a interagirem em frente a um computador portátil

As inscrições para a edição de 2025 da formação decorrem até às 17h do dia 23 de maio.

Químico a escrever fórmulas num quadro

Curso acreditado para efeitos de progressão na carreira dos professores do Ensino Básico e Secundário do Grupo 510 (CCPFC/ACC-118288/22), com candidaturas até 18 de maio.

Curso destinado a estudantes de Mestrado e de Doutoramento, bem como a profissionais que desenvolvam investigação científica na área da saúde.

Título/data/local do evento e fotografia do mar

Quais são os conceitos-chave para enfrentar os atuais desafios marinhos e costeiros? 

Representação de programação R

This course aims at providing students with basic knowledge of R programming, allowing them to manipulate and visualize data with R.

Daniel da Silva Distinguished Lecture, por Jean-Pierre Bourguignon (IHÉS).

The conference focuses on "Algebra and its role in Computer Science", with special emphasis on the areas of study related to the work of M. V. Volkov, such as semigroups and automata.

Workshop organizado pelo CEMS.UL - Centro de Estudos Matemáticos e pelo CAMGDS - Centro de Análise Matemática, Geometria e Sistemas Dinâmicos.

Título/data/local do evento e fotografia do espaço

How far will you go? The IA Summer Program 2025 is your launchpad to the Universe - apply until 26 May!

Representação de programação R

This course aims at providing students with statistical knowledge and tools to manipulate, analyse and visualise biological data with R. Introduction to modeling, simulations and Bayesian statistics.

Logótipo do Verão na ULisboa, sobre um fundo azul

Candidaturas a partir de 07 de abril!

Computability in Europe (CiE) is an interdisciplinary series of international conferences organised by the Association Computability in Europe (ACiE).

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