Na madrugada do dia 18 de março de 1978 registou-se um incêndio de grandes proporções na Faculdade de Ciências, na altura situada na Rua da Escola Politécnica. Foi considerado um dos maiores incêndios ocorridos na cidade de Lisboa, pela extensão, pela importância dos bens consumidos pelo fogo e pela perigosidade dos materiais armazenados. O incêndio, que faz parte da memória coletiva da instituição, teve um forte impacto no dia-a-dia de docentes, não-docentes e alunos. Em 2018, a Direção de Ciências assinala o 40.º aniversário do incêndio.