Data Science Seminars

Machine learning-based protein design for bioengineering gene therapy vectors

Sala 6.3.27, Ciências ULisboa

Por Ana Filipa Rodrigues (LASIGE).

Machine learning (ML) transformed protein design, offering unprecedented opportunities to accelerate and refine the development of bioengineered proteins. Building on the latest advancements in this area, researchers are extending these innovations to therapeutic viral particles, focusing on viral vectors for gene therapy. The precise design and bioengineering of viral particles hold immense potential not only to advance the field of virus-based therapeutics, such as viral gene therapy, but also to foster discoveries in virology, including uncovering virus-host interactions and developing better vaccines and antivirals.

In ML-based protein design, models are trained on protein sequence data to learn the complex relationship between amino acid sequences and their corresponding effects on protein function. These models learn to navigate the sequence-to-function fitness landscape, enabling the prediction and the design of novel proteins with specific characteristics. This seminar will cover the core methodologies in ML-guided protein design, emphasizing key concepts, models, and applications. It will also explore how these advancements are being leveraged in the bioengineering of viral vectors, focusing on our ongoing research on designing new adeno-associated viral vectors (AAVs) for human gene therapy.

Short bio: Ana Filipa Rodrigues holds a Ph.D. in Biotechnology (2014) from NOVA University Lisbon and the University of Minnesota (USA). Her early research focused on improving viral vector production for human gene therapy using functional genomics and genetic engineering. In her post-doctoral research at the Experimental Virology Department of Hannover Medical School/TWINCORE (Germany), she studied virus-host interactions to aid the development of antiviral therapies and vaccines.

In recent years, Filipa has worked at the intersection of academic research and the biopharmaceutical industry, specializing in cell and gene therapy, viral vaccines, molecular biology, and bioprocess engineering. She has recently joined the LASIGE Research Centre for Computer Science and Engineering at the University of Lisbon, where she applies machine learning to design and bioengineer therapeutic viral particles.

14h30
Título "5th edition ULisses", sobre fotografia do mar

Prazo de apresentação de candidaturas prolongado até 15 de janeiro.

Seminário do Centro de Estatística e Aplicações da Universidade de Lisboa e do Centro de Matemática Computacional e Estocástica, por Milan Stehlík (Institute of Statistics, Universidad de Valparaíso, Valparaíso, Chile).

Seminário do Instituto de Astrofísica e Ciências do Espaço, por David Mulryne (Queen Mary University of London).

Título "European Strategy Discussion" e mapa estilizado da Europa

O encontro visa promover o diálogo entre investigadores e consolidar ideias para a contribuição nacional - uma oportunidade única para alinhar as prioridades científicas de Portugal com a estratégia europeia, discutir os desafios da área e reforçar a colaboração entre investigadores.

Representação antiga da cidade de Lisboa

A conferência está limitada a 100 participantes - realize já a sua inscrição e reserve o dia na sua agenda.

Título/data/local do evento e fotografia de barragem

Concerto pelo Coro de Câmara da Universidade de Lisboa (CCUL) da Associação Coral da Universidade de Lisboa (ACUL), e que integra a iniciativa Música na Universidade de Lisboa.

O evento, que conta com a participação do CIUHCT, terá a participação, entre outros, do matemático e historiador da matemática Professor Robin Wilson (Reino Unido) e do criador do primeiro museu de ciência dedicado inteiramente à matemática, Professor Albrecht Beutelspacher (Alemanha).

Logótipo da ULisboa, título/data/local do evento e fotografia de professora e estudantes numa biblioteca

Workshop no âmbito do Programa de Promoção da Saúde Mental e do Bem-Estar na ULisboa.

Título do curso e logótipo do CEAUL

Aprenda a organizar e analisar dados com foco na obtenção de soluções orientadas para a resolução de problemas.

Com o Inverno já a deixar a sua marca nos ramos nus das árvores, é tempo também de as ajudarmos a crescer na Primavera que se seguirá!

Ação de formação para docentes e investigadores de CIÊNCIAS.

Logótipos CIÊNCIAS/CEAUL, indicação do título/data/orador e representação do cérebro humano

Participants will be introduced to using R in real life situations. From the start, this hands-on practical workshop will focus on following good programming and data analysis practices. 

Imagem abstrata

Candidaturas abertas até 14 de fevereiro - em 2025, serão atribuídos 26 Prémios e 52 Menções Honrosas.

Fotografia de João Paulo Dias

A Celebration of his 80th Birthday - registration until 24 January.

Um evento dedicado às três áreas de estudo do DEGGE: Engenharia da Energia e Ambiente; Meteorologia, Oceanografia e Geofísica; Engenharia Geoespacial.

Título "Bolsas de Doutoramento Unite! ULisboa", logótipos das entidades promotoras e fotografia de jovem investigadora a utilizar um laptop na esplanada de um café

O 4.º concurso decorre até 28 de fevereiro.

Título "Ciências Forenses / Forensic Sciences", sobre mosaico de fotografias alusivas à temática

O curso visa disponibilizar aos profissionais com formação universitária inicial ao nível da licenciatura os conhecimentos básicos e a informação necessária ao eventual futuro ingresso e exercício de funções em áreas Médico-Legais e Forenses - candidaturas até 05 de fevereiro.

Reitoria da ULisboa

O ato eleitoral decorrerá nos dias 31 de março e 01 de abril de 2025.

A leading venue for presenting and discussing the latest research, industrial practice and innovations in dependable and secure computing.

Um concurso de programação dirigido aos alunos do ensino secundário (11.º e 12.º anos), que visa promover a prática e o gosto pela programação.

Data e logótipo do Dia Aberto, inseridos em mosaico de atividades de investigação

Bem-vindos a Ciências ULisboa!