Conferências do cE3c

Sala 2.2.14, FCUL, Lisboa

Por Klaus Harms e João A. Gama (“The Arctic University of Norway", Tromsø, Norway).


How bacteria feed and breed on fragmented, random environmental DNA | 11h00-11h45
Klaus Harms
“The Arctic University of Norway", Tromsø, Norway

Bacteria propagate by cell division, resulting in offspring cells that are, save for mutations, genetically identical with their ancestors. However, bacteria can dramatically increase genetic diversity through so-called horizontal gene transfer (HGT). In the course of HGT, external intraspecies DNA that reaches the cytoplasm can be recombined with the cellular DNA, allowing uncoupled mixing of alleles and resulting in population structures that resemble those of sexual organisms. More rarely, HGT leads to acquisition of foreign DNA that contains novel genetic information. In an evolutionary perspective, such new DNA enables bacteria to develop novel traits and to conquer previously inaccessible environmental niches.
HGT can be conferred through transduction, conjugation, transformation and, less frequently, through a number of further, less well characterized processes. Natural transformation is the active uptake of DNA from the environment by bacteria and its subsequent integration into the genome. A prerequisite for naturally transformable bacteria is the initiation of a physiological state named competence for DNA uptake.
DNA is released into the environment mostly by dead organisms, but some bacteria also actively excrete DNA. Under many environmental conditions, free DNA is quickly degraded by fragmentation and further chemical damages such as deamination, base loss, or cross-links with organic molecules. Moreover in complex environments, heterologous DNA vastly outnumbers the available homologous DNA. On the other hand, even heavily fragmented, chemically damaged, and fragmentary heterologous DNA can still transform bacteria, but the result is not acquisition of genes, but mutational modification of the bacterial genomic DNA. In this talk, I describe the mechanisms, benefits, and constraints of natural transformation by such DNA substrates.


Why some E. coli strains are not good plasmid hosts | 11h45-12h30
João A. Gama
“The Arctic University of Norway", Tromsø, Norway

Escherichia coli comprises strains ranging from commensal to pathogenic. Some of them may harbour accessory genetic elements such as plasmids, which play an important role in bacterial adaptation. However, plasmids can be lost in the absence of selection, as shown with model organisms. We studied the effects of a clinical plasmid encoding antibiotic resistance against carbapenems (last resort antibiotics) on a sample of clinical E. coli representing different sequence types (ST).
We aim to understand how different E. coli strain backgrounds face plasmid acquisition.
Most strains maintained the plasmid for ≈300 generations. Compared to other strains, ST73 strains grew slower when acquiring the plasmid (plasmid fitness cost). Moreover, plasmid conjugative transfer from the original isolate was particularly lower into ST73 strains. In agreement, analysis of E. coli genomes revealed lower frequency of plasmids in ST73 genomes than in the other STs studied. Defense mechanisms against horizontal gene transfer, such as restriction-modification systems, could be responsible for this behaviour. Comprehensive bioinformatical analysis showed that type III restriction-modification systems are more frequently present in ST73 genomes. Furthermore, there is a negative correlation between plasmid carriage and presence of type III restriction-modification systems among ST73 genomes.
Overall, these data may explain, at least in part, why molecular epidemiology studies suggest that ST73 is less associated with antibiotic resistance determinants.

11h00-12h30
cE3c - Centro de Ecologia, Evolução e Alterações Ambientais

Edgar Tito Matias Oliveira Martins defende a dissertação "Recolha de Cyberthreat Open Source Intelligence usando técnicas de correlação de informação".

Por Paulo Oliva (Queen Mary, University of London).

Decorrerão, durante a conferência, sessões práticas sobre o uso de ferramentas avançadas de computação e processamento de dados em infraestruturas distribuídas.

Pedro Miguel dos Santos Pinto defende a tese "Proof mining with the bounded functional interpretation".

Joana Teresa de Almeida Fernandes defende a tese "Avaliação do risco cardiovascular na Atividade Seguradora".

Por André Abath (Universidade Federal Minas Gerais Belo Horizonte).

O evento conta com a participação de Thibault Langlois (Ciências ULisboa), que irá apresentar o tema "Deep Learning: over-view and examples of applications in O&G engineering".

Logótipo associado à frase "CASE STUDY RESISTIR", sobre um fundo branco

A emergência de "hospitais inteligentes" proporciona a oportunidade para a implementação na área das doenças infecciosas dos novos sistemas de medicina preditiva, personalizada, preventiva e participativa (P4 Medicine).

Mariana Marques, do cE3c, contribuiu para esta obra com fotografias de mamíferos obtidas através de armadilhagem fotográfica, no âmbito da sua tese de mestrado.

Por Joana Nunes da Costa (Universidade de Coimbra).

Logótipo da Noite Europeia dos Investigadores, sobre um fundo branco

Ciência na cidade é o tema da Noite Europeia dos Investigadores do biénio 2018-2019, o qual pretende aproximar investigadores e sociedade em atividades preparatórias e durante as noites da última sexta-feira de setembro.

Rodrigo Arimura Osawa defende a tese "Degradação de contaminantes emergentes: um estudo por espectrometria de massa e outras técnicas analíticas".

Imagem de uma sweatshirt azul, com o logótipo estampado do Programa Erasmus +

Estágios para recém-graduados: Candidaturas online de 01 a 30 de setembro de 2019.

Diogo Miguel dos Santos Martins defende a dissertação "Assessment of the spatio-temporal variability and estimation accuracy of drought indices and evapotranspiration".

Almoços com Ciências

Especialistas de Ciências ULisboa conversam informalmente sobre temas atuais, durante o almoço.

A iniciativa visa estreitar as relações entre investigação, produtores e consumidores através da agroecologia.

Pôr-do-sol em Lisboa

Lisboa será palco da Primeira Conferência Internacional Comunidades de Energia.

A conferência é organizada pela Coopérnico - Cooperativa de Energias Renováveis, através do projeto COMPILE, e pelo grupo CCIAM do cE3c, FCUL, através dos projetos PROSEU e BEACON.

Almoços com Ciências

Especialistas de Ciências ULisboa conversam informalmente sobre temas atuais, durante o almoço.

As provas, requeridas por Miguel Brás de Carvalho, decorrem nos dias 17 e 18 de outubro de 2019.

No dia 18 de outubro, será apreciado o sumário do seminário/lição com o título "Statistical modeling of extremes".

A iniciativa conta com a participação de Diana Prata (Instituto de Biofísica e Engenharia Biomédica, FCUL / King’s College, London UK / ISCTE, Lisbon, Portugal), que irá debater o tema "The neurobiology of morality: the role of oxytocin".

Logótipo da IAESTE, acompanhado de imagens de jovens

Interessado em realizar um estágio extracurricular a nível internacional?

Imagem ilustrativa do evento, acompanhada de várias informações (título, dia, hora, local e entidades intervenientes)

Are you a ULisboa student and do you consider yourself a problem solver? Do you want to know more about innovation and entrepreneurship and experience it hands on?

VI Feira da Matemática

Dois dias repletos de atividades científicas, culturais e educativas dirigidas a todos os públicos.

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