PhD in Informatics Seminar

Recommender systems for scientific items: a Hybrid semantic recommender algorithm for chemical compounds

Transmissão através de Videoconferência

Speaker: Márcia Barros.

Abstract: Recommender systems have been widely used in fields such as movies, music and online stores, however, they are poorly applied to scientific fields. We identified as one of the main challenges for using recommender systems in scientific fields, the lack of datasets suitable for evaluating recommender algorithms. In previous work, we overcame this challenge by developing a new methodology called LIBRETTI (LIterature Based RecommEndaTion of scienTific Items). LIBRETTI allows the creation of standard datasets of implicit feedback with the format of , where the users are authors from research papers, the items are scientific items, such as chemical compounds, genes, or phenotypes, and the ratings are the number of papers an author wrote about an item. We have now as case studies a dataset in the field of Astronomy, and a dataset in the field of Chemistry. With these dataset available, it is now possible to start testing and developing new recommender algorithms. Thus, this seminar will present a Hybrid recommender model for recommending Chemical Compounds. The Hybrid model integrates state-of-the-art collaborative-filtering algorithms for implicit feedback and a new content-based algorithm, based on the semantic similarity between the Chemical Compounds in the ChEBI ontology. This model was evaluated using the dataset of implicit feedback of Chemical Compounds, CheRM, created through LIBRETTI.

More information: https://moodle.ciencias.ulisboa.pt/course/view.php?id=2228#section-2.

z(r)oom: https://videoconf-colibri.zoom.us/j/98030464254.


Seminars of the PhD in Informatics 2019/2020

PhD students, faculty, MSc and BSc students, are all invited to attend. This is an excellent opportunity for cross-disciplinary development through presentation and discussion of edge research going on in our department.

Please make space in your agenda an save the date, even if the subject is apparently not directly related to your research. You may be surprised with the bridging opportunities that pop up, and the PhD student will benefit from comments that we all can make.

Moreover, we all should adopt the scientific culture of attending our most advanced regular seminars and of providing our feedback to the speakers.

12h00
Departamento de Informática

Um grupo de investigadores em diferentes fases da carreira, da licenciatura ao pós-doutoramento, irá reunir-se para melhorar os artigos da Wikipedia relacionados com a História e a Filosofia da Ciência e da Tecnologia, sobretudo em tópicos relacionados com Portugal e as ciências ibéricas

Título/data do curso, logótipos dos organizadores e nome da formadora

This course provides a thorough introduction to the most widely used methods of program evaluation, also known as impact assessment. 

Título/data do evento e fotografia da oradora

TWIN2PIPSA Expert Seminar, por Sophie Jackson (Yusuf Hamied Department of Chemistry, University of Cambridge).

Talk @LASIGE, por Fernando Gallego Donoso (University of Malaga, Computational Intelligence in Biomedicine - ICB).
 

Título/data/local da iniciativa, sobre representação de plantas, aves e insetos

Comemorações do 30.º aniversário da VicenTuna - Tuna da Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa.

Cromeleque dos Almendres

Sessão no âmbito do ciclo de conversas "Aqui, no Universo", por Fábio Silva e Luís Tirapicos (moderação de Vânia Maia).

This 7th edition will once again gather specialists in the field of Combinatorial Optimization from several countries to present and discuss recent research work.

Título "Bolsas de Doutoramento Unite! ULisboa", logótipos das entidades promotoras e fotografia de jovem investigadora a utilizar um laptop na esplanada de um café

O 3.º concurso decorre até 30 de abril.

Título/data da iniciativa e fotografia de quatro pessoas segurando vasos com plantas

Venha aprender como cultivar um futuro urbano mais sustentável!

Seminário do Centro de Física Teórica e Computacional, por Carlos Pires (Instituto Dom Luiz e Departamento de Engenharia Geográfica, Geofísica e Energia, Faculdade de Ciências, Universidade de Lisboa, Portugal).

Fotografia de utente a interagir com um médico através de teleconsulta

O workshop, organizado pela redeSAÚDE da ULisboa, pretende explorar de que forma tecnologias de base digital emergentes na área da saúde podem contribuir para o bem-estar e para a melhoria da prestação de cuidados de saúde.

Logótipos do programa, de Ciências ULisboa e do GAPsi

Programa de Intervenção de Carreira, com inscrições até 26 de abril.

Estátua representativa da biodiversidade do planeta Terra

Seminários de Tese no âmbito do Doutoramento em Biologia e Ecologia das Alterações Globais.

O encontro reúne cientistas, profissionais e estudantes de diferentes áreas e regiões do país focados em desenvolver a investigação marinha, em linha com a Década da Ciência Oceânica para o Desenvolvimento Sustentável, proclamada pelas Nações Unidas (2021-2030).

Formação modular de 13 de abril a 11 de maio - produção em permacultura.

Logótipo da ação CLEANFOREST

Forests are exposed to multiple global change drivers, wich can constrain their ability to continue providing several ecosystem services (including climate change mitigation). Assessing responses - and underlined mechanisms -  at the whole ecosystem scale is paramount for a holistic understanding of forest response to global change.

Título e data do evento, inseridos em fotografia de cinco jovens em contexto de investigação

Pré-inscrições já disponíveis!

Logótipo do evento

Evento final do Projeto iSEA, com inscrições até 30 de abril.

Título e data do workshop

Workshop no âmbito da recente adesão da Universidade de Lisboa à CoARA - Coalition for Advancing Research Assessment.

Título do curso

Curso Avançado CEAUL / Gades Solutions.

Título e datas de candidatura do programa, sobre um padrão em tons de roxo e laranja

Submissão de candidaturas até 14 de maio.

Logótipo do LIP Summer Internship Program e fotografia de jovem investigador

Os estágios podem ter uma duração entre duas semanas e dois meses e realizam-se nos três polos do LIP - candidaturas até 15 de maio.

Os oradores plenários irão falar sobre a importância da interdisciplinaridade de forma acessível para todos, estando previstas palestras e apresentação de pósteres por alunos.

Logótipo do EVM 2024

Candidaturas até 15 de maio.

Um evento dirigido aos alunos do ensino secundário, consistindo numa palestra sobre a microscopia e em visitas aos laboratórios de microscopia/demonstrações experimentais simples.

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