PhD in Informatics Seminar

Recommender systems for scientific items: a Hybrid semantic recommender algorithm for chemical compounds

Transmissão através de Videoconferência

Speaker: Márcia Barros.

Abstract: Recommender systems have been widely used in fields such as movies, music and online stores, however, they are poorly applied to scientific fields. We identified as one of the main challenges for using recommender systems in scientific fields, the lack of datasets suitable for evaluating recommender algorithms. In previous work, we overcame this challenge by developing a new methodology called LIBRETTI (LIterature Based RecommEndaTion of scienTific Items). LIBRETTI allows the creation of standard datasets of implicit feedback with the format of , where the users are authors from research papers, the items are scientific items, such as chemical compounds, genes, or phenotypes, and the ratings are the number of papers an author wrote about an item. We have now as case studies a dataset in the field of Astronomy, and a dataset in the field of Chemistry. With these dataset available, it is now possible to start testing and developing new recommender algorithms. Thus, this seminar will present a Hybrid recommender model for recommending Chemical Compounds. The Hybrid model integrates state-of-the-art collaborative-filtering algorithms for implicit feedback and a new content-based algorithm, based on the semantic similarity between the Chemical Compounds in the ChEBI ontology. This model was evaluated using the dataset of implicit feedback of Chemical Compounds, CheRM, created through LIBRETTI.

More information: https://moodle.ciencias.ulisboa.pt/course/view.php?id=2228#section-2.

z(r)oom: https://videoconf-colibri.zoom.us/j/98030464254.


Seminars of the PhD in Informatics 2019/2020

PhD students, faculty, MSc and BSc students, are all invited to attend. This is an excellent opportunity for cross-disciplinary development through presentation and discussion of edge research going on in our department.

Please make space in your agenda an save the date, even if the subject is apparently not directly related to your research. You may be surprised with the bridging opportunities that pop up, and the PhD student will benefit from comments that we all can make.

Moreover, we all should adopt the scientific culture of attending our most advanced regular seminars and of providing our feedback to the speakers.

12h00
Departamento de Informática
Microplásticos em suspensão no oceano

O curso tem como objetivo dar formação sobre a problemática da contaminação por detritos de plástico dos nossos ecossistemas, bem como alertar para os potenciais efeitos deletérios nos organismos - candidaturas até 22 de março.

Banner do Dia de Ciências 2025

A 29 de abril assinalamos o 114.º aniversário de CIÊNCIAS.

Junte-se a nós no Grande Auditório de CIÊNCIAS para uma tarde de celebração que reúne toda a comunidade da Faculdade.

Fotografia de fábrica a emitir poluição para a atmosfera

The course aims at enabling the participants to use different methods to measure the impacts of pollutants on ecosystems.

Logótipo C-Academy

O curso oferece uma base sólida sobre os fundamentos e práticas essenciais para proteger sistemas e dados num mundo cada vez mais digital - candidaturas até 13 de abril.

Banner Dia Aberto de CIÊNCIAS 2025.

Bem-vindos a Ciências ULisboa!

Um concurso de programação dirigido aos alunos do ensino secundário (11.º e 12.º anos), que visa promover a prática e o gosto pela programação.

Fotografia de Chapim-azul

The goal of this course is to provide the participants with the most recent and practical knowledge on the use of Functional Diversity.

Ação de formação para docentes e investigadores de CIÊNCIAS.

Químico a escrever fórmulas num quadro

Curso acreditado para efeitos de progressão na carreira dos professores do Ensino Básico e Secundário do Grupo 510 (CCPFC/ACC-118288/22), com candidaturas até 18 de maio.

Título da conferência, sobre um quadro de ardósia

A conferência decorre nos dias 26 e 27 de junho - mais informações brevemente disponíveis.

Computability in Europe (CiE) is an interdisciplinary series of international conferences organised by the Association Computability in Europe (ACiE).

Composição de imagens relativas à área das ciências forenses

O curso visa dotar os formandos, com formação universitária nas mais diversas áreas do saber, com os conhecimento necessários à integração de equipas profissionais multidisciplinares nas áreas Médico-Legais e Forenses, em Laboratórios ou Serviços Médico-Legais e Forenses.

Cientista a trabalhar com tubos de ensaio

Este curso forma profissionais para atividade na área das Análises Clínicas ou Patologia Clínica. Irão adquirir os conhecimentos essenciais à integração de equipas profissionais multidisciplinares na área das Análises Clínicas/Patologia Clínica, em laboratórios privados, públicos, hospitalares ou do Estado.

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