TMT - Ten Minutes Talk with the PhD students in Informatics

Deep Learning System for Biomedical Relation Extraction Combining External Sources of Knowledge

Transmissão através de Videoconferência

Conversa com Diana Sousa (LASIGE, DI-FCUL).

Successful biomedical relation extraction can provide evidence to researchers about possible unknown associations between entities, advancing our current knowledge about those entities and their inherent processes. Multiple relation extraction approaches have been proposed to identify relations between literature concepts, namely using neural networks algorithms. However, most approaches do not use external sources of knowledge as added resources, such as domain-specific ontologies. Moreover, dataset availability is still limited to train reliable models. In this seminar, I will present the advantages of integrating multiple ontologies into a BI-LSTM deep learning system. Additionally, how to create high-quality biomedical training corpora by allying distant supervision with crowdsourcing. The ultimate goal of the thesis is to use external semantic sources of knowledge along with the latest state-of-the-art language representations to improve the current performance of biomedical relation extraction both in English and non-English languages.
 
Short Bio: Diana Sousa received the B.S. degree in biochemistry and the M.Sc. degree in bioinformatics and computational biology from the Faculty of Sciences, University of Lisbon, Lisbon, Portugal, in 2017 and 2019, respectively, where she is currently pursuing the Ph.D. degree in informatics. Since 2016, she has been a Researcher with the LASIGE, Department of Informatics, Faculty of Sciences, University of Lisbon. Her research interest includes the development of text mining systems that aim at extracting biomedical information from biomedical literature, mainly focusing on relations between biomedical entities and on using deep learning approaches that resort to external sources of knowledge.


Transmissão em direto via Zoom.

17h45

Seminário do Instituto de Astrofísica e Ciências do Espaço, por Pier-Stefano Corasaniti (Observatoire de Paris-Meudon, France).

Seminário de Lógica Matemática, por Antonio Piccolomini D'Aragona (University of Tübingen/University of Siena).

Seminário do Centro de Física Teórica e Computacional, por Hugo Terças (Departamento de Física do Instituto Superior de Engenharia de Lisboa, Instituto Politécnico de Lisboa / Instituto de Plasmas e Fusão Nuclear, Instituto Superior Técnico, Universidade de Lisboa, Portugal).

Um programa estruturado que combina discussões em grupo, exploração de carreira e workshops informativos, com inscrições até 23 de maio.

Uma oportunidade para fortalecer a cultura de segurança e bem-estar em CIÊNCIAS.

Logótipo do EVM 2025

O objetivo é proporcionar a estudantes de todo o país - que estejam a concluir o 2.º ou 3.º ano de licenciaturas em Matemática, Física ou áreas afins - a oportunidade de participar num projeto de investigação com a duração de duas semanas - candidaturas até 28 de maio.

Seminário no âmbito do Doutoramento em Biologia e Ecologia das Alterações Globais, por Pierina Jocelyn Mendoza Yengle.

Cartaz do filme "O Melhor dos Mundos"

A 29 de maio o filme "O Melhor dos Mundos” é exibido numa sessão especial em CIÊNCIAS, promovida pela FCiências.ID e o Instituto Dom Luiz. Após a projeção do filme, realiza-se uma mesa redonda com quatro especialistas em Sismologia, que responderão a perguntas do público.

Uma oportunidade única para interagir com a comunidade global de computação científica.

Logótipo Moodle

Ação de formação para docentes e investigadores de CIÊNCIAS.

Copilot Chat

Nesta sessão, serão exploradas as funcionalidades e benefícios do Microsoft 365 Copilot Chat de forma personalizada à comunidade académica de CIÊNCIAS.

Logótipo Mentimeter

Ação de formação para docentes e investigadores de CIÊNCIAS.

Luís Saraiva (Ciências ULisboa) é o coordenador nacional do evento.

Título/data/local do evento e iconografia representativa de energias renováveis

Junta-te a esta revolução energética e faz a diferença!

Comemoração do Dia Mundial da Segurança dos Alimentos em CIÊNCIAS.

Neste curso ficarás a saber como te podes tornar um permacultor eficiente, produtivo e consciente! O curso está preparado para iniciantes na prática de permacultura.

Formação - Cultivar em Permacultura.

Pessoas a interagirem em frente a um computador portátil

As inscrições para a edição de 2025 da formação decorrem até às 17h do dia 23 de maio.

Químico a escrever fórmulas num quadro

Curso acreditado para efeitos de progressão na carreira dos professores do Ensino Básico e Secundário do Grupo 510 (CCPFC/ACC-118288/22), com candidaturas até 18 de maio.

Curso destinado a estudantes de Mestrado e de Doutoramento, bem como a profissionais que desenvolvam investigação científica na área da saúde.

Título/data/local do evento e fotografia do mar

Quais são os conceitos-chave para enfrentar os atuais desafios marinhos e costeiros? 

Representação de programação R

This course aims at providing students with basic knowledge of R programming, allowing them to manipulate and visualize data with R.

The conference focuses on "Algebra and its role in Computer Science", with special emphasis on the areas of study related to the work of M. V. Volkov, such as semigroups and automata.

Logótipo do Verão na ULisboa, sobre um fundo azul

Candidaturas a partir de 07 de abril!

Título/data/local do evento e fotografia do espaço

How far will you go? The IA Summer Program 2025 is your launchpad to the Universe - apply until 26 May!

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