Equipa do DI vence competição internacional em "Ontology Matching"

OAEI
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Uma equipa do Departamento de Informática (DI) de Ciências vence competição internacional em correspondência de ontologias.

O Ontology Alignment Evaluation Initiative (OAEI) é uma competição internacional, iniciada em 2005, e que visa avaliar ferramentas de emparelhamento de ontologias.

O projeto SOMER, aprovado em 2012 e financiado pela Fundação para a Ciência e a Tecnologia, possibilitou o desenvolvimento do sistema AML - AgreementMakerLight -, derivado do AgreementMaker, uma plataforma amplamente utilizada em emparelhamento de ontologias desenvolvido pelos colaboradores do Laboratório de Isabel F. Cruz.

Nos últimos anos, a equipa do LASIGE tem desenvolvido aplicações que exploram os dados e conhecimento contido em ontologias. Este grupo especializou-se em prospeção de texto biomédico e medidas de semelhança semântica.

No âmbito do projeto SOMER, o grupo de Ciências, coordenado elo professor do DI, Francisco M. Couto, participou no OAEI 2013 e no OAEI 2014, tendo alcançado este ano o primeiro lugar em todas as tarefas para as quais o AML tinha sido desenvolvido.

Existe também uma colaboração com a Janssen Pharmaceutical Companies of Johnson & Johnson que ficou muito agradada com a possibilidade de usar o AML na gestão dos seus dados. Neste Momento o AML está também a ser explorado para um projeto no âmbito da Food and Agriculture Organization of the United Nations.

“A equipa desenvolveu o sistema AML para competir em seis tarefas (das nove no total), e em todas essas seis ficou em 1.º lugar! Um agradecimento especial ao Daniel Faria por ter passado todo o agosto nisto e a toda a equipa de Ciências envolvida - Cátia Pesquita, Emanuel Santos e Catarina Martins, sem esquecer todo o apoio da equipa de Isabel Cruz, professora da Universidade de Illinois, em Chicago.”
Francisco M. Couto

 

Sobre a perfomance AML

"AML was a step ahead and obtained the best average Recall and F-Measure, and the second best average Precision."

"The biggest improvement in F-measure, as well as the best overall result is achieved by AML, which increases its F-measure by seven percentage points."

"AML* has a better F-Measure than any other system before (4% increase compared to the best matcher of last year)."

"Same as the last year, the AML system set the top result for the anatomy track by improving the result from the last year."

"AML has similar results both in terms of precision and recall and outperforms the other systems in terms of F-measure (for both cases)."

"Tools are ordered according to their highest average F1-measure." (AML in the 1st place).

Notícia atualizada a 27/10/2014

DI com GCIC

“Os ensinamentos adquiridos em Ciências estão na base das investigações que tenho desenvolvido, foi através deles que adquiri os conceitos e conhecimentos que me permitem desenvolver o estudo dos materiais. Por outro lado, a interação com diferentes áreas da Geologia permite absorver muita informação importante para a interpretação de muitos dos achados”, explica a investigadora Elisabete Malafaia.

Jean-Paul Montagner, Institut de Physique du Globe, Université Paris-Diderot, Paris, France

António Castelo, Aidnature

"Recordo-me sobretudo dos professores e da matéria que dava nas aulas. A minha pancada com evolução é forte e já nessa altura era. Ainda hoje nada me dá mais prazer do que aprender e compreender como funciona a vida na terra. Tive muito bons professores durante o curso e isso foi fundamental até quando, mais tarde, saí para fazer o mestrado em Inglaterra", conta o antigo aluno de Biologia de Ciências, António Castelo.

Expedição Aidnature

“Cada animal, cada comportamento é um desafio. O momento em que conseguimos a imagem de que estamos à espera e que imaginámos na nossa cabeça, é de uma adrenalina enorme, que contrasta com a paz que é estar horas no campo à espera”, declara António Castelo, antigo aluno do curso de Biologia de Ciências, agora biólogo na Aidnature.

 Nos dias 29 e 31 de outubro de 2014 realiza-se uma reunião em Heildelberg, na Alemanha, com o intuito de apresentar os 106 novos membros ao EMBO Council.

Ano Internacional da Cristalografia 2014

O Departamento de Geologia da Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa associa-se à comemoração do Ano Internacional da Cristalografia.

MATEMÁTICA E ENSINO

De acordo com o Despacho do Senhor Diretor da Faculdade, a eleição do Presidente do Departamento de Matemática terá lugar no próximo dia 30 de Maio.

Conferência no dia 16 de Maio, 11h30, anfiteatro 3.2.15, Edifício C3, FCUL, Campo Grande, Lisboa.

Marta Lourenço

Marta Lourenço, membro do Centro Interuniversitário de História das Ciências e da Tecnologia, da Secção Autónoma de História e Filosofia das Ciências e subdiretora do Museu Nacional de História Natural e da Ciência foi galardoada com a Medalha George Sarton pela Universidade de Gent.

Imagem de Octávio Pinto

O seminário integrado na disciplina de Agricultura e Florestas, do mestrado em Ecologia e Gestão Ambiental, realiza-se dia 7 de maio, pelas 11h15, no edifício C2, 2.º piso, sala 2.2.14.

Christoph Meyer

Christoph Meyer começou a trabalhar no Centro de Biologia Ambiental de Ciências, em fevereiro de 2009. A estadia em Ciências tem corrido bem.

Tectonics and Neotectonics of the western North America and Associated Hazards

Conferência no dia 29 de Maio, 12h00, sala 6.2.56, Edifício C6, FCUL, Campo Grande, Lisboa.

EuroGP2014

Stefano Ruberto, Leonardo Vanneschi, Mauro Castelli & Sara Silva foram distinguidos com o best paper award for EuroGP 2014, durante a "17th European Conference on Genetic Programming", ocorrida entre 23 e 25 de abril, em Granada, Espanha.

A Biblioteca do Conhecimento Online, celebra o seu 10.º Aniversário

“Nestas formações, ensina-se, entre outros aspetos, a detetar situações de paragem cardiorrespiratória precocemente, a saber ligar o 112 rapidamente, sabendo dizer o que é importante, e iniciar manobras básicas, como compressões torácicas para manter alguma circulação e oxigenação dos órgãos vitais até à chegada de ajuda”, explicou o formador do INEM, Rui Rebelo.

The biosphere-atmosphere interactions mediate the largest exchanges in the global carbon cycle. Understanding the role of climate and other environmental factors on the carbon cycle of terrestrial ecosystems is key for assessing vulnerabilities and future feedback into the climate system.

A reportagem multimédia “Sonhar com o futuro” inclui testemunhos de candidatos ao ensino superior e que participaram na edição do ano passado do Dia Aberto.

Carla Nunes, Maria M. M. Santos e Carlos Baleizão

Os desafios que os novos mecanismos de financiamento suscitam apelam à criação de equipas multidisciplinares e complementares que incrementem o impacto da investigação desenvolvida.

Com o objetivo de mostrar as funções, tarefas e responsabilidades do cientista, o Departamento de Química e Bioquímica, o Departamento de Biologia Vegetal  e o IBEB receberam nos seus laboratórios 12 alunos do 12.º ano do Colégio São João de Brito.

Imagem editada pelo DI

O project Lusica e a contribuição para a exposição Retro Computing no 

Pormenor do cartaz do Programa de Estímulo à Investigação 2013

Entre 1994 e 2013, a Fundação Calouste Gulbenkian atribuiu bolsas a 32 alunos da Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa ao abrigo do Programa de Estímulo à Investigação. Na última edição Alexandra Symeonides e Sara Realista foram as felizes contempladas.

Alexandra Symeonides

“A Fundação Calouste Gulbenkian, com este incentivo, está a permitir-me começar uma atividade de investigação na área da análise estocástica mas, sobretudo, está a permitir-me ganhar bagagem para vir a explorar esta área em projetos a outros níveis”, reforça a investigadora do Grupo de Física Matemática da Universidade de Lisboa.

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