PhD in Informatics Seminar

Recommender systems for scientific items: a Hybrid semantic recommender algorithm for chemical compounds

Transmissão através de Videoconferência

Speaker: Márcia Barros.

Abstract: Recommender systems have been widely used in fields such as movies, music and online stores, however, they are poorly applied to scientific fields. We identified as one of the main challenges for using recommender systems in scientific fields, the lack of datasets suitable for evaluating recommender algorithms. In previous work, we overcame this challenge by developing a new methodology called LIBRETTI (LIterature Based RecommEndaTion of scienTific Items). LIBRETTI allows the creation of standard datasets of implicit feedback with the format of , where the users are authors from research papers, the items are scientific items, such as chemical compounds, genes, or phenotypes, and the ratings are the number of papers an author wrote about an item. We have now as case studies a dataset in the field of Astronomy, and a dataset in the field of Chemistry. With these dataset available, it is now possible to start testing and developing new recommender algorithms. Thus, this seminar will present a Hybrid recommender model for recommending Chemical Compounds. The Hybrid model integrates state-of-the-art collaborative-filtering algorithms for implicit feedback and a new content-based algorithm, based on the semantic similarity between the Chemical Compounds in the ChEBI ontology. This model was evaluated using the dataset of implicit feedback of Chemical Compounds, CheRM, created through LIBRETTI.

More information: https://moodle.ciencias.ulisboa.pt/course/view.php?id=2228#section-2.

z(r)oom: https://videoconf-colibri.zoom.us/j/98030464254.


Seminars of the PhD in Informatics 2019/2020

PhD students, faculty, MSc and BSc students, are all invited to attend. This is an excellent opportunity for cross-disciplinary development through presentation and discussion of edge research going on in our department.

Please make space in your agenda an save the date, even if the subject is apparently not directly related to your research. You may be surprised with the bridging opportunities that pop up, and the PhD student will benefit from comments that we all can make.

Moreover, we all should adopt the scientific culture of attending our most advanced regular seminars and of providing our feedback to the speakers.

12h00
Departamento de Informática
Título/data/local do evento e fotografia da oradora

TWIN2PIPSA Expert Seminar, por Louise Serpell (Sussex Neuroscience, School of Life Sciences, University of Sussex).

Título da exposição e composição de duas fotografias (água e incêndio)

As 80 fotografias que compõem a exposição revelam a mestria técnica dos seus autores, mas não só: foram registadas em momentos completamente inóspitos.

Palestra por Carlos Reinaldo Mendes (antigo aluno de CIÊNCIAS).

Seminário de Geometria e Física, por Fabrizio Del Monte (University of Birmingham, UK).

Microplásticos em suspensão no oceano

O curso tem como objetivo dar formação sobre a problemática da contaminação por detritos de plástico dos nossos ecossistemas, bem como alertar para os potenciais efeitos deletérios nos organismos - candidaturas até 22 de março.

Banner do Dia de Ciências 2025

A 29 de abril assinalamos o 114.º aniversário de CIÊNCIAS.

Junte-se a nós no Grande Auditório de CIÊNCIAS para uma tarde de celebração que reúne toda a comunidade da Faculdade.

Pormenor de pintura representativa da cidade de Aden

O curso, com Jorge Flores (CIUHCT), oferece uma visão da história da Ásia a partir de cidades portuárias cruciais nas relações com o Ocidente.

Logótipo C-Academy

O curso oferece uma base sólida sobre os fundamentos e práticas essenciais para proteger sistemas e dados num mundo cada vez mais digital - candidaturas até 13 de abril.

Fotografia de fábrica a emitir poluição para a atmosfera

The course aims at enabling the participants to use different methods to measure the impacts of pollutants on ecosystems.

Curso destinado a todos que necessitem de realizar análise de dados com recurso ao R.

Banner Dia Aberto de CIÊNCIAS 2025.

Bem-vindos a Ciências ULisboa!

Um concurso de programação dirigido aos alunos do ensino secundário (11.º e 12.º anos), que visa promover a prática e o gosto pela programação.

Fotografia de Chapim-azul

The goal of this course is to provide the participants with the most recent and practical knowledge on the use of Functional Diversity.

O encontro tem como objetivo divulgar e promover os resultados da investigação produzidos nos dois pólos do Centro de Química Estrutural (CIÊNCIAS e IST), estimulando a criatividade, o trabalho interdisciplinar e o espírito científico.

Mão a segurar em globo de vidro

Curso acreditado pelo CCPFC para efeitos de progressão na carreira dos professores na dimensão cientifico-pedagógica dos grupos 230, 420, 510, 520 e 560, com candidaturas até 30 de abril.

Título/data/local do evento, logótipos das entidades organizadoras e fotografia de peixe

The event aims to facilitate the exchange of information and knowledge among professionals to advance the understanding, collaboration and capabilities of aquaculture to respond to the impact of climate change in a rapidly changing global environment.

Uma oportunidade única para interagir com a comunidade global de computação científica, com inscrições (preço reduzido) até 02 de maio.

Logótipo Moodle

Ação de formação para docentes e investigadores de CIÊNCIAS.

Título/data/local do evento e iconografia representativa de energias renováveis

Inscrições a partir de 07 de abril! Junta-te a esta revolução energética e faz a diferença!

Curso destinado a estudantes de Mestrado e de Doutoramento, bem como a profissionais que desenvolvam investigação científica na área da saúde.

Químico a escrever fórmulas num quadro

Curso acreditado para efeitos de progressão na carreira dos professores do Ensino Básico e Secundário do Grupo 510 (CCPFC/ACC-118288/22), com candidaturas até 18 de maio.

Título/data/local do evento e fotografia do mar

Quais são os conceitos-chave para enfrentar os atuais desafios marinhos e costeiros? 

Título da conferência, sobre um quadro de ardósia

The conference focuses on "Algebra and its role in Computer Science", with special emphasis on the areas of study related to the work of M. V. Volkov, such as semigroups and automata.

Logótipo do Verão na ULisboa, sobre um fundo azul

Candidaturas a partir de 07 de abril!

Computability in Europe (CiE) is an interdisciplinary series of international conferences organised by the Association Computability in Europe (ACiE).

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