BioISI Research Seminar

How and why do proteins tie themselves into knots?

Transmissão através de Videoconferência

Por Sophie Jackson (University of Cambridge, UK).

For decades it was considered impossible for the linear polypeptide chain of a protein to tie itself into a knot. Despite this dogma, in the year 2000 and much to the surprise of the structural biology community, it was shown that there are many protein structures which have a knot in them.  There are four known types of knotted structure found in naturally occurring proteins: 31 (trefoil knot), 41 (figure of eight knot) , 52 (Gordian knot) and 61 (stevedore knot). The talk will start with a brief history of knotted proteins, and will then go on to discuss what we currently know from experimental and computational studies about how these proteins with complex structures form in silico, in vitro and in vivo. In the second part of the talk, what we know about the properties of protein knots, such as their stability and function, and the similarities/differences with unknotted proteins will be described. This part of the talk will attempt to address the question, why are there knots in proteins?

References:

  • Simien, J.M. & Haglund, E. (2021) Topological twists in nature. Trends Biochem. Sci. 46, 461-471;
  • Jackson, S.E. (2020) Why are there knots in proteins? AMS Contemporary Mathematics, 746, 129-153;
  • Sulkowska, J.I. (2020) On folding of entangled proteins: knots, lassos, links and q-curves. Curr. Opin. Struct. Biol. 60, 131-141;
  • Jackson, S.E., Suma, A. & Micheletti, C. (2017) How to fold intricately: using theory and experiments to unravel the properties of knotted proteins. Curr. Opin. Struct. Biol. 42, 6-14.

Transmissão em direto via Zoom.

11h00
BioISI - Instituto de Biossistemas e Ciências Integrativas
Cardume

Seminário do Centro de Física Teórica e Computacional, por Ana Machado (IPMA, Lisboa, Portugal).

Seminário do Departamento de Física de Ciências ULisboa, por Sofia Fernandes (FCUL-IBEB).

Seminário do Centro de Estatística e Aplicações da Universidade de Lisboa e do Centro de Matemática Computacional e Estocástica, por Xavier Piulachs (Polytechnic University of Catalonia, Barcelona, Spain).

Pintura representativa de grupo de pessoas

A arte dos oradores, apaixonados pela rainha das ciências, dá o tom a esta sessão.

Título/data/local do evento e fotografia de estudante

Workshop no âmbito do Programa de Promoção da Saúde Mental e do Bem-Estar na ULisboa.

Seminário de Lógica Matemática, por Luís Pereira (Universidade de Lisboa).

Planta

As candidaturas terminam a 20 de março, estando previstos vários eventos de matchmaking para ajudar os participantes a encontrar parceiros para os seus projetos.

Horta Solar

A 21 de março, CIÊNCIAS celebra o segundo aniversário da Horta Solar, um projeto pioneiro que alia a produção de alimentos à geração de energia limpa.

Pintura abstrata em tons de azul, laranja e amarelo

Seminário do Centro de Física Teórica e Computacional, por Mariana Oliveira (ICECO - Aveiro Institute of Materials, University of Aveiro, Portugal).

Representação de folhas de árvores

Concerto no âmbito do programa Música na Universidade de Lisboa.

Alunos de CIÊNCIAS

Uma iniciativa gratuita, dirigida aos estudantes do 1.º e 2.º ciclo de estudos de CIÊNCIAS, com inscrições até 20 de março.

Logótipo C-Academy

Combinando teoria e prática, o curso prepara os alunos para compreenderem a infraestrutura digital moderna e aplicarem esses conhecimentos em cenários reais, com foco em arquiteturas robustas, deteção de erros e soluções para redes de alto desempenho.

Título "Cybersecurity Executive Program Edição 2025", sobre um fundo em tons de verde

Adotar boas medidas e práticas de Cibersegurança é fundamental nos dias de hoje, para qualquer empresa, para proteger a integridade, confidencialidade e disponibilidade de dados sensíveis e pessoais, reduzindo o risco de ataques e fraudes.

Título/data/local do evento e representação de floresta

Esta é a altura certa para fazer os últimos preparativos para uma agrofloresta viçosa e produtiva que nos dará fruta, biodiversidade e sombra nos meses mais quentes.

Reitoria da ULisboa

O ato eleitoral decorrerá nos dias 31 de março e 01 de abril de 2025.

Sala de aula

Curso creditado para efeitos de progressão na carreira dos professores do Ensino Secundário dos grupos 500 e 550, com candidaturas até 25 de março.

Logótipo da Semana da Sustentabilidade

O foco da da SDS’25 é abrir espaço à reflexão sobre como as nossas ações, hoje, poderão influenciar o amanhã, sendo, assim, o lema desta Edição “Pelo Futuro, o Amanhã começa Hoje“.

Fotografia de criança a observar plantas com uma lupa

This course aims to explore ways of communicating science to non-specialized audiences, such as policy makers, industry, general public (including students and teachers), through their engagement and participation in citizen science activities.

Fotografia de coleção de insetos

The course includes several case studies of insect adaptation, and the most recent overview on insect evodevo, plasticity, ecophysiological responses and conservation under global change.

A leading venue for presenting and discussing the latest research, industrial practice and innovations in dependable and secure computing.

O maior evento de empregabilidade de CIÊNCIAS, a decorrer nos dias 08 e 09 de abril.

Título/data/local do evento e fotografia da cidade de Lisboa

The conference aims to bring together students and young researchers working in Mathematics, Statistics, and Applications with a view to fostering discussions and collaborations amongst participants.

Título "Para um ensino humanista das ciências" e logótipos das entidades organizadoras

O evento tem como tema principal "Para um ensino humanista das ciências" e conta com a participação de vários professores de CIÊNCIAS.

Microplásticos em suspensão no oceano

O curso tem como objetivo dar formação sobre a problemática da contaminação por detritos de plástico dos nossos ecossistemas, bem como alertar para os potenciais efeitos deletérios nos organismos - candidaturas até 22 de março.

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