BioISI Research Seminar

The function of the exoribonuclease DIS3L2 in nonsense-mediated mRNA decay and cancer

Sala 3.2.13, Ciências ULisboa

Por Luísa Romão (BioISI /INSA).

The nonsense-mediated mRNA decay (NMD) pathway selectively degrades mRNAs carrying a premature translation-termination codon but also regulates the abundance of a large number of physiological RNAs that encode full-length proteins. In human cells, NMD-targeted mRNAs are degraded by endonucleolytic cleavage and exonucleolytic degradation from both 5’ and 3’ ends. This is done by a process not yet completely understood that recruits decapping and 5’-to-3’ exonuclease activities, as well as deadenylating and 3’-to-5’ exonuclease activities. In our lab, we have been unveiling the role of the 3’-to-5’ exoribonuclease DIS3L2 in NMD. We have observed that some specific NMD-targets are in fact direct DIS3L2 substrates. In addition, we now know that DIS3L2 acts over full-length transcripts, through a process that also involves the UPF1 NMD player, and depends on the activity of the terminal uridylyl transferases (TUTases) Zcchc6/11 (TUT7/4). We are now testing which NMD-inducing features contribute to DIS3L2 target specificity.

Most of the literature that concerns DIS3L2 characterizes its involvement in several RNA degradation pathways, however, there is some evidence that its dysregulated activity may contribute to cancer development. We characterized the role of DIS3L2 in human colorectal cancer (CRC). Using the public RNA datasets from The Cancer Genome Atlas, we found higher DIS3L2 mRNA levels in CRC tissues than in normal colonic samples. In addition, our RNA deep-sequencing data revealed that DIS3L2 depletion induces a strong transcriptomic disturbance in SW480 CRC cells. Moreover, gene ontology analysis of significant upregulated transcripts displays enrichment in mRNAs encoding proteins involved in cell cycle regulation and cancer-related pathways. This guided us to evaluate which specific hallmarks of cancer are differentially regulated by DIS3L2. To do so, we employed four CRC cell lines (HCT116, SW480, Caco-2 and HT-29) differing in their mutational background and oncogenicity. We observed that depletion of DIS3L2 reduces the viability of highly oncogenic SW480 and HCT116 CRC cells. We also found that the mTOR signaling pathway, crucial for cell viability and survival, is suppressed upon DIS3L2 depletion in those cell lines. Moreover, loss of DIS3L2 expression impairs SW480 and HCT116 cell migration and invasion. Interestingly, interference with DIS3L2 expression does not significantly affect any of these properties in the low oncogenic Caco-2 and HT-29 CRC cell lines, nor in control NCM460 non-transformed colonocytes. Collectively, these results contribute to improve our understanding of DIS3L2 function in key hallmarks of cancer and suggest a pro-tumorigenic role for this ribonuclease in advanced CRCs.

11h30
BioISI - Instituto de Biossistemas e Ciências Integrativas
Física de altas energias

workshop é destinado a estudantes e investigadores em inicio de carreira que tenham interesse na aplicação de técnicas de machine learning à física de altas energias, com especial referência às experiências do LHC no CERN.

Logótipo da Unite! e fotografia de três estudantes

2nd Unite!-Ed Future Conference.

Logótipo do Dia Internacional da Matemática

Atividades a decorrerem em CIÊNCIAS nos dias 14 e 19 de março.

A Academia das Ciências de Lisboa e o Seminário de Jovens Cientistas celebram a Matemática no panorama científico nacional e em sua relação com a sociedade.

Fotografia de jovens investigadores

Inscrições até 15 de março.

Título "Jornadas de Matemática" e logótipos das entidades envolvidas

O Departamento de Matemática e o Núcleo de Estudantes de Matemática e Matemática Aplicada associam-se às celebrações do Dia Internacional da Matemática.

Cardume

Seminário do Centro de Física Teórica e Computacional, por Ana Machado (IPMA, Lisboa, Portugal).

Seminário de Lógica Matemática, por Luís Pereira (Universidade de Lisboa).

Planta

As candidaturas terminam a 20 de março, estando previstos vários eventos de matchmaking para ajudar os participantes a encontrar parceiros para os seus projetos.

A Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa celebra o segundo aniversário da Horta Solar, um projeto pioneiro que alia a produção de alimentos à geração de energia limpa.

Pintura abstrata em tons de azul, laranja e amarelo

Seminário do Centro de Física Teórica e Computacional, por Mariana Oliveira (ICECO - Aveiro Institute of Materials, University of Aveiro, Portugal).

Alunos de CIÊNCIAS

Uma iniciativa gratuita, dirigida aos estudantes do 1.º e 2.º ciclo de estudos de CIÊNCIAS, com inscrições até 20 de março.

Logótipo C-Academy

2.ª edição do curso, com candidaturas até 17 de março.

Representação de folhas de árvores

Concerto no âmbito do programa Música na Universidade de Lisboa.

Título "Cybersecurity Executive Program Edição 2025", sobre um fundo em tons de verde

Adotar boas medidas e práticas de Cibersegurança é fundamental nos dias de hoje, para qualquer empresa, para proteger a integridade, confidencialidade e disponibilidade de dados sensíveis e pessoais, reduzindo o risco de ataques e fraudes.

Título/data/local do evento e representação de floresta

Esta é a altura certa para fazer os últimos preparativos para uma agrofloresta viçosa e produtiva que nos dará fruta, biodiversidade e sombra nos meses mais quentes.

Fotografia de criança a observar plantas com uma lupa

This course aims to explore ways of communicating science to non-specialized audiences, such as policy makers, industry, general public (including students and teachers), through their engagement and participation in citizen science activities.

Logótipo da Semana da Sustentabilidade

O foco da da SDS’25 é abrir espaço à reflexão sobre como as nossas ações, hoje, poderão influenciar o amanhã, sendo, assim, o lema desta Edição “Pelo Futuro, o Amanhã começa Hoje“.

Sala de aula

Curso creditado para efeitos de progressão na carreira dos professores do Ensino Secundário dos grupos 500 e 550, com candidaturas até 25 de março.

Reitoria da ULisboa

O ato eleitoral decorrerá nos dias 31 de março e 01 de abril de 2025.

Fotografia de coleção de insetos

The course includes several case studies of insect adaptation, and the most recent overview on insect evodevo, plasticity, ecophysiological responses and conservation under global change.

A leading venue for presenting and discussing the latest research, industrial practice and innovations in dependable and secure computing.

O maior evento de empregabilidade de CIÊNCIAS, a decorrer nos dias 08 e 09 de abril.

Título/data/local do evento e fotografia da cidade de Lisboa

The conference aims to bring together students and young researchers working in Mathematics, Statistics, and Applications with a view to fostering discussions and collaborations amongst participants.

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