Seminário

RNA Polymerase interactions and elongation rate

Transmissão através de Videoconferência

Por Gunter M. Schütz (Institute of Biological Information Processing and Institute for Advanced Simulation, Forschungszentrum Jülich, Germany).

We show that non-steric molecular interactions between RNA polymerase (RNAP) motors that move simultaneously on the same DNA track determine strongly the kinetics of transcription elongation. With a focus on the role of collisions and cooperation, we introduce a stochastic model that allows for the exact analytical computation of the stationary properties of transcription elongation as a function of RNAP density, their interaction strength, nucleoside triphosphate concentration, and rate of pyrophosphate release. We show that cooperative pushing, i.e., an enhancement of the average RNAP velocity and elongation rate, requires a molecular repulsion beyond steric hindrance and in excess of a critical strength. It disappears beyond a critical RNAP density, above which jamming due to collisions takes over. However, for strong repulsion and at the same time strong stochastic blocking, cooperative pushing at low RNAP densities is suppressed  and a reentrance regime at higher densities appears. For a simpler model we report density anticorrelations along the track that arise from slow transcription sites.


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Topic: CFTC weekly seminar

Time: Apr 8, 2021 10:00 AM Lisbon

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10h00
CFTC - Centro de Física Teórica e Computacional
titulo e data do evento

A major vehicle to bring together the national Physical Chemistry community.

Seminário do Laboratório de Instrumentação e Física Experimental de Partículas, por Pedro Cruz (Northeastern University).

Logótipo do EVM 2024

Por Giosuè Muratore (DM Ciências ULisboa e CMAFcIO).

Logótipo do EVM 2024

Por Pedro Duarte (DM Ciências ULisboa, CMAFcIO).

Título do programa, sobre mosaico de fotografias de jovens cientistas

As candidaturas encontram-se encerradas. Obrigada aos quase 80 candidatos/as!

Fotografia de ilha

Seminários Doutorais no âmbito da disciplina de Projeto de Investigação (Doutoramento em Ciências do Mar).

Logótipo do EVM 2024

Por Maria Manuel Torres (DM Ciências ULisboa e CMAFcIO).

Seminário do Centro de Matemática, Aplicações Fundamentais e Investigação Operacional, por Baptiste Claustre (aluno ENS Lyon, estagiário CMAFcIO).

Logótipo do EVM 2024

Por: Jorge Buescu (DM Ciências ULisboa e CMAFcIO).

Titulo e data do evento, com imagem de ponte sobre o tejo

Um evento organizado no âmbito da Ação COST EURO-MIC, de cujo Comitê de Gestão Elisabete Silva, líder do Bioactive and Multifunctional Materials Lab do BioISI, faz parte.

Logótipo do EVM 2024

Por Jean-Baptiste Casteras (DM Ciências ULisboa e CMAFcIO).

Chegou a hora: os participantes do Programa Ser Cientista vão apresentar os projetos que desenvolveram ao longo de uma semana, acompanhados por docentes e investigadores de CIÊNCIAS. E todos podem assistir!

Imagem do evento

Extended enrolement date until July 12th.

Logótipo do evento, sobre um fundo branco

Um evento de reunião da comunidade nacional nas diversas vertentes da informática, com a ambição de ser o fórum de eleição para a divulgação, discussão e reconhecimento de trabalhos científicos.

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Imagem do evento - título, local e data do evento

Investigação Ecológica ao Serviço da Conservação

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