Métodos Computacionais em Evolução e Ecologia
Ano Letivo: 2015/16
Departamento: Biologia Vegetal
Carga horária: T: 1:00 h; TP: 1:30 h; OT: 0:30 h;
Área Científica: Biologia;
Objetivos da Unidade Curricular
Ver pagina da cadeira em:
http://webpages.fc.ul.pt/~fadionisio/MCEE.htm
Objectivo principal: compreender técnicas de optimização de estratégias quando a estratégia óptima depende da estratégia dos outros indivíduos da mesma espécie. Os alunos tomarão contacto com métodos computacionais que são, ao mesmo tempo, tópicos actuais de investigação. OS alunos terão a oportunidade de compreender a unidade entre fenómenos tão diversos como: (i) a proporção do número de machos e fêmeas em diversas espécies, (animais, plantas e protozoários); (ii) o altruísmo e a selecção de grupo; (iii) conflito parental; e (v) imprinting genómico em mamíferos e plantas com flor; etc.
Pré-requisitos
Sem pré-requisitosConteúdos
Teoria de Jogos Evolutiva. Jogos discretos e contínuos. Estratégias de Nash. Estratégias Evolutivamente Estáveis.
Equação de Shaw-Moler e a teoria de Fisher da alocação do sexo: aplicações aos animais e plantas (incluindo evolução de hermafroditismo e outras formas de co-sexualidade para dioécicas, ou ginodioécicas, ou androdioécicas)
Altruísmo e Spite – a Equação de Price
Competição na família: conceitos matemáticos e exemplos em plantas de semente (angiospérmicas e gimnospérmicas) e mamíferos.
Modelo de Smith-Fretwell para compreenção do tamanho de sementes.
Modelo de Trivers
Imprinting Genómico: plantas de semente e mamíferos
Descrição detalhada dos conteúdos programáticos
Componente Teórica
Parte 1: Introdução a alguns conceitos fundamentais da matemática.
Derivadas, máximos, mínimos, série de Taylor, regressão linear, covariance.
Parte 2: Conceitos básicos de genética de populações.
Equilíbrio de Hardy-Weinberg. Selecção num locus. Fitness dependente da frequência. Modelo de S. Wright.
Parte 3: Teoria de Jogos Evolutiva. Jogos discretos e contínuos. Estratégias de Nash. Estratégias Evolutivamente Estáveis.
Parte 4: Métodos computacionais em evolução e ecologia.
Equação de Shaw-Moler e a teoria de Fisher da alocação do sexo: aplicações aos animais e plantas (incluindo evolução de hermafroditismo e outras formas de co-sexualidade para dioécicas, ou ginodioécicas, ou androdioécicas)
Altruísmo e Spite – a Equação de Price
Competição na família: conceitos matemáticos e exemplos em plantas de semente (angiospérmicas e gimnospérmicas) e mamíferos.
Modelo de Smith-Fretwell para compreenção do tamanho de sementes.
Modelo de Trivers
Imprinting Genómico: plantas de semente e mamíferos
Componente Teórica-Prática
Problemas que seguem os temas leccionados na Componente Teórica.
Componente Prática
Inexistente
Bibliografia
Recomendada
A. Rogers. "Fundamental Methods in Ecology and Evolution". 2008
F. Dionísio "Uma Tampa para cada Tacho - Conflitos Genéticos e Evolução.". 2011. Editorial Bizâncio, Lisboa
Outros elementos de estudo
Métodos de Ensino
Expor os temas no quadro e discuti-los.
Métodos de Avaliação
Serão fornecidos problemas em cinco aulas para resolução na aula, onde as quatro melhores notas contarão para 50% da nota final da cadeira. Alternativamente, os alunos poderão resolver um problema que lhes será fornecido no início do semestre e que deverá ser entregue na última aula (50% da nota final).
Exame final com consulta (50% da nota final)
Língua de ensino
Portuguese or english