BioISI Research Seminar

The cork oak EST project - Uncovering the molecular basis of mycorrhizal symbiosis using next generation sequencing

Sala 1.3.15, FCUL, Lisboa

Por Mónica Sebastiana, PhD (BioISI / FCUL).

Abstract: Ectomycorrhizal symbiosis is essential for the life and health of trees in temperate and boreal forests where it plays a major role in nutrient cycling and in functioning of the forest ecosystem. Trees with ectomycorrhizal root tips are more tolerant to environmental stresses, such as drought, and biotic stresses such as root pathogens. Detailed information on these molecular processes is essential for the understanding of symbiotic tissue development in order to optimize the benefits of this natural phenomenon. The current project is integrated in the effort for covering the transcriptome of Quercus suber and is focused on ECM symbiotic interaction. Next generation sequencing tools allow the analysis of non model ectomycorrhizal plant-fungal interactions that can contribute to find the “symbiosis toolkits” and better define the role of each partner in the mutualistic interaction. By using 454 pyrosequencing we compared ectomycorrhizal cork oak roots with non-symbiotic roots. From the two cDNA libraries sequenced, over 2 million reads were obtained that generated 19552 cork oak root unique transcripts. A total of 2238 transcripts were found to be differentially expressed when ECM roots were compared with non-symbiotic roots. These up- and down-regulated genes lead to the identification of a number of insights into the molecular mechanisms governing this important symbiosis. In cork oak roots, ectomycorrhizal colonization resulted cell wall remodelling, activation of the secretory pathway, alterations in flavonoid biosynthesis, and expression of genes involved in the recognition of fungal effectors, like those implicated in pathogenic interactions. In addition, we identified genes involved in specific ectomycorrhizal functions such as nutrient exchange with the fungal partner, increased lateral root formation or root hair decay. These findings provide a global overview of the transcriptome of an ectomycorrhizal host root, and constitute a foundation for future studies on the molecular events controlling this important symbiosis.

11h00
BioISI - Instituto de Biossistemas e Ciências Integrativas
Pormenor de pintura representativa da cidade de Aden

O curso, com Jorge Flores (CIUHCT), oferece uma visão da história da Ásia a partir de cidades portuárias cruciais nas relações com o Ocidente.

Logótipo C-Academy

O curso oferece uma base sólida sobre os fundamentos e práticas essenciais para proteger sistemas e dados num mundo cada vez mais digital - candidaturas até 13 de abril.

Fotografia de fábrica a emitir poluição para a atmosfera

The course aims at enabling the participants to use different methods to measure the impacts of pollutants on ecosystems.

Performance teatral

A apresentação pública do FATAL - Festival Anual de Teatro Académico de Lisboa contará com uma homenagem a Rogério de Carvalho, figura marcante do Teatro português, sendo igualmente apresentada a programação do festival.

Logótipo MindTec

5 de maio - lançamento do projeto de rebranding interno que pretende repensar e redesenhar, em conjunto com a nossa comunidade académica, a identidade do Tec Labs.

Seminário do Centro de Física Teórica e Computacional, por Fábio Chalub (NOVA Math, Universidade NOVA de Lisboa, Portugal).

Curso destinado a todos que necessitem de realizar análise de dados com recurso ao R.

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Bem-vindos a Ciências ULisboa!

Um concurso de programação dirigido aos alunos do ensino secundário (11.º e 12.º anos), que visa promover a prática e o gosto pela programação.

Vista a partir de cima de pessoas a trabalharem sobre uma mesa de madeira

CIÊNCIAS desenvolve um conjunto de atividades de apoio aos Doutorandos, periodicamente enquadradas no âmbito do PhD Support Programme.

O encontro tem como objetivo divulgar e promover os resultados da investigação produzidos nos dois pólos do Centro de Química Estrutural (CIÊNCIAS e IST), estimulando a criatividade, o trabalho interdisciplinar e o espírito científico.

O evento reunirá alunos de Ciências ULisboa e do ISCAL, proporcionando-lhes uma oportunidade única para apresentarem e defenderem os seus projetos empreendedores num formato de pitch.

Fotografia de Chapim-azul

The goal of this course is to provide the participants with the most recent and practical knowledge on the use of Functional Diversity.

Mão a segurar em globo de vidro

Curso acreditado pelo CCPFC para efeitos de progressão na carreira dos professores na dimensão cientifico-pedagógica dos grupos 230, 420, 510, 520 e 560, com candidaturas até 30 de abril.

Título/data/local do evento, logótipos das entidades organizadoras e fotografia de peixe

The event aims to facilitate the exchange of information and knowledge among professionals to advance the understanding, collaboration and capabilities of aquaculture to respond to the impact of climate change in a rapidly changing global environment.

Uma oportunidade única para interagir com a comunidade global de computação científica, com inscrições (preço reduzido) até 02 de maio.

Logótipo Moodle

Ação de formação para docentes e investigadores de CIÊNCIAS.

Título/data/local do evento e iconografia representativa de energias renováveis

Inscrições até 16 de maio! Junta-te a esta revolução energética e faz a diferença!

Químico a escrever fórmulas num quadro

Curso acreditado para efeitos de progressão na carreira dos professores do Ensino Básico e Secundário do Grupo 510 (CCPFC/ACC-118288/22), com candidaturas até 18 de maio.

Curso destinado a estudantes de Mestrado e de Doutoramento, bem como a profissionais que desenvolvam investigação científica na área da saúde.

Título/data/local do evento e fotografia do mar

Quais são os conceitos-chave para enfrentar os atuais desafios marinhos e costeiros? 

Representação de programação R

This course aims at providing students with basic knowledge of R programming, allowing them to manipulate and visualize data with R.

The conference focuses on "Algebra and its role in Computer Science", with special emphasis on the areas of study related to the work of M. V. Volkov, such as semigroups and automata.

Logótipo do Verão na ULisboa, sobre um fundo azul

Candidaturas a partir de 07 de abril!

Representação de programação R

This course aims at providing students with statistical knowledge and tools to manipulate, analyse and visualise biological data with R. Introduction to modeling, simulations and Bayesian statistics.

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