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Development of microbial cell factories - from the genome to production

Sala 6.3.38, FCUL, Lisboa

The field of Metabolic Engineering (ME) has gained a major importance, since it allows the design of improved microorganisms for industrial applications, starting with wild-type strains that usually have low production capabilities in terms of the target compounds. The ultimate aim of ME is to identify genetic manipulations in silico leading to improved microbial strains, that can be implemented using novel molecular biology techniques. This task, however, is a complex one, requiring the existence of reliable metabolic models for strain simulation and robust optimization algorithms for target identification.
Strain simulation is usually performed by using Genome-scale stoichiometric models and Linear or Quadratic Programing methods that assume a steady state over the intracellular metabolites. Strain design adds one level of complexity as it requires the formulation of bi-level optimization problems that can be tackled with Evolutionary algorithms.
In this talk, I will go through the main concepts of genome-scale modelling and the simulation and design of microbial cell factories while describing our group’s main contributions to the field.

Short Bio: Isabel Rocha teaches Bioinformatics and Systems Biology at Minho University where she is the PI of several projects in Systems Biology applied to Industrial Biotechnology and Life Sciences, with more than 100 papers published in international journals, books and international conferences. She did her PhD in Chemical and Biological Engineering at Minho University in Portugal and a Post-Doc in Systems Biology at the Technical University of Denmark. She spent one semester at MIT and she is part of the MIT-Portugal Program Faculty, being the head of a National program in Teaching innovation and entrepreneurship. She is co-founder and Scientific Director of both SilicoLife and Biotempo. Biotempo is focused on Bioprocess Development for the food industry while SilicoLife develops improved microbial strains for industrial applications using in silico methods.

14h00
Departamento de Informática

Talk por Nessrine Farhat.

Seminário do Laboratório de Instrumentação e Física Experimental de Partículas, por Oleg Denisov (Università di Torino, Università del Piemonte Orientale and INFN Sezione di Torino).

Um dia para aprender sobre produção caseira de cogumelos, da teoria à prática! Cada participante leva consigo um kit de cogumelos produzido nesta tarde e ainda todo o conhecimento para o fazer novamente, de forma autónoma!

Seminário do Centro de Física Teórica e Computacional, por Bruno Amorim (International Iberian Nanotechnology Laboratory, Braga, Portugal).

Título/data/local do evento e representação de dinossáurios

Conferência no âmbito do Dia Internacional da Geodiversidade, por Pedro Mocho (DG / IDL).

Título/data/local do evento e fotografia de comboio

Evento no âmbito do Ciclo de Conferências "Conversas à 3.ª", promovido pela redeMOV da Universidade de Lisboa.

Pormenor de mão a apontar para o ecrã de um computador portátil

As inscrições para a edição de 2024 (workshops 4, 5 e 6) encontram-se abertas até às 17h do dia 22 de setembro.

Título/data/local do evento e três objetos do dia a dia

A exposição reúne uma seleção de projetos de design pertencentes à Coleção Paulo Parra, que demonstram na prática a enorme influência que a Bauhaus e a escola de Ulm tiveram na produção industrial durante o séc. XX e, por conseguinte, na qualidade de vida de milhares de pessoas que os utilizaram no seu dia a dia. 

O outono aproxima-se a passos largos e não tarda está aí o inverno... que alimentos se cultivam nesta altura do ano? Não sabes quais e como? Tens um terreno ao qual gostarias de dar algum uso?

Título/data/local do evento e fotografias dos três oradores

A sessão irá partilhar exemplos de boas práticas de três instituições de ensino superior, nomeadamente de CIÊNCIAS.

Título/data/local do evento e fotografia de três jovens

Conferência no âmbito do VII Encontro dos Presidentes dos Conselhos Gerais das Universidades Públicas Portuguesas - a entrada é livre, mediante inscrição prévia.

Data e logótipo do evento

Atenção! Este evento vai aumentar a tua pressão arterial. O WBME é um evento de entrada livre que certamente não vais querer perder!

Título da iniciativa e fotografia de pessoas a correr

A Universidade de Lisboa associa-se à Corrida Sempre Mulher, oferecendo as primeiras 70 inscrições na Caminhada, para integrar o grupo da ULisboa. A iniciativa é aberta a toda a comunidade da ULisboa, mediante inscrição até 07 de outubro.

Logótipo de Ciências ULisboa, título/data do evento, título "Time for Science, Science of Time" e representação gráfica de ampulheta

Join us on October 22 (Tuesday) for the 6th edition of Ciências Research & Innovation Day: an opportunity for faculty, researchers and innovators to share their work with both the internal and external community, fostering collaboration and networking.

Título/data/local do evento e três fotografias relacionadas com a permacultura

Permacultura? Não é uma pseudociência esotérica? Uma utopia sem fundamento científico? Para desmistificar estas e outras ideias, o permacultor certificado Tiago Silva (SmartLeap) guiar-te-á pelos caminhos desta prática multidisciplinar, fundada em sólidas bases empíricas.

Título "Prémio Universidade de Lisboa '23"

Instituído com o apoio da Caixa Geral de Depósitos, o Prémio ULisboa tem como objetivo distinguir e premiar uma individualidade de nacionalidade portuguesa ou estrangeira, que tenha contribuído de forma notável para o progresso e o engrandecimento da Ciência e/ou Cultura e projeção internacional de Portugal.

Logótipo e data do evento

O primeiro Tropical Summit visa reunir líderes de todo o mundo para abordar os desafios tropicais mais prementes.

Imagem do evento - título, local e data do evento

Investigação Ecológica ao Serviço da Conservação

An annual meeting that aims to bring together Evolutionary Biologists working in Portugal and abroad in order to promote scientific cohesion and excellence. This meeting is a forum for scientists of all academic levels (from master students to principal investigators), to present their work and discuss, fostering new ideas and collaborations.

A leading venue for presenting and discussing the latest research, industrial practice and innovations in dependable and secure computing.