As comemorações contam com diversas iniciativas, incluindo várias organizadas pelo cE3c - Centro de Ecologia, Evolução e Alterações Ambientais. É a quarta vez que se assinala esta efeméride, cuja proposta de criação tem raízes no cE3c.

No âmbito da celebração desta data, o cE3c partilha um conjunto de vídeos com conversas de Cristina Cruz, investigadora do cE3c (Ciências ULisboa), com especialistas de várias áreas do saber e da sociedade. Cristina Cruz é uma das investigadoras que inicialmente propôs o assinalar desta efeméride. O Dia Internacional do Microrganismo assinala-se a 17 de setembro por ter sido nesta data, em 1683, que o cientista holandês Anton van Leeuwenhoek enviou uma carta à Royal Society de London descrevendo pela primeira vez um microrganismo, lançando a base para a microbiologia.