Seminário Doutoral

K-RET: Knowledgeable Biomedical Relation Extraction System

Sala 6.3.27, Ciências ULisboa

Por Diana Sousa (orientador: Francisco Couto).

Relation Extraction is a crucial process to deal with the amount of text published daily, for example, to find missing associations in a database. Relation Extraction is a text mining task for which the state-of-the-art approaches use bidirectional encoders, namely, BERT. However, most systems lack external knowledge injection, which is more problematic in the biomedical area given the widespread usage and high quality of biomedical ontologies. This knowledge can propel these systems forward by aiding them in predicting more explainable biomedical associations. With this in mind, in this seminar, I will present K-RET, a novel, knowledgeable biomedical relation extraction system that is, for the first time, able to handle different associations, integrate knowledge from multiple sources, define where to apply it, and deal with multi-token entities. K-RET was tested on three open-access corpora (DDI, BC5CDR, and PGR) integrated with four biomedical ontologies handling different entities. K-RET improved state-of-the-art results by 2.68% on average, with the DDI yielding the most significant boost in performance, from 79.60% to 87.88% in F-measure.

12h00-13h00
Departamento de Informática | Ciências ULisboa
Título/data/local do evento, sobre a Tabela Periódica

This year's program will cover two plenary sessions hosted by Susete Pinteus and Hugo Miranda, complemented by oral presentations, flash talks, and poster communications. Finally, a round table discussion will take place at the end of our meeting.

Logótipo do prémio

As candidaturas à 11.ª edição decorrem até 28 de junho.

Vai realizar-se em Lisboa, nos dias 28 e 29 de junho de 2024, o 37.º Encontro do Seminário Nacional de História da Matemática.

Logótipo do Verão na ULisboa, sobre um fundo amarelo

Uma oportunidade única de conheceres e experimentares o ritmo e o espírito da vida académica!

Título/data/local do evento e representação do cérebro humano

O maior evento anual na área da ciência e da tecnologia em Portugal.

The topics of the conference include (but are not limited to) classical and quantum integrable systems, complex geometry of moduli spaces, automorphic forms and their applications to number theory.

Título/data do evento, logótipos das entidades organizadoras e fotografia de Lisboa (Castelo de S. Jorge e respetiva colina)

Inscrição (taxa reduzida) até 20 de abril.

Título/data/local do evento, logótipos das entidades organizadoras e várias fotografias da orla costeira e de pessoas

Escola de verão com um programa muito diversificado, com especialistas em vários tópicos, que vão falar sobre formas de olhar para o nosso planeta de uma forma integrada, juntando conhecimentos de várias disciplinas.

Are you a BSc or MSc student interested in Soft Matter, Non-linear Dynamics and Waves or Particle Physics?

Vem investigar connosco!

Logótipo do evento, sobre um fundo branco

Um evento de reunião da comunidade nacional nas diversas vertentes da informática, com a ambição de ser o fórum de eleição para a divulgação, discussão e reconhecimento de trabalhos científicos.

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