António E. N. Ferreira é, atualmente, Professor Auxiliar do Departamento de Química e Bioquímica, coordenador da licenciatura em Bioquímica, e membro do grupo de Enzimologia do Centro de Química e Bioquímica da FCUL. Desde o seu doutoramento em 2002, tem centrado grande parte da sua investigação científica em abordagens teóricas e computacionais da Bioquímica e Biologia de Sistemas, em particular a modelação cinética, simulação e análise computacional de processos celulares a problemas de quantificação da distribuição de fluxos metabólicos, parametrização de cinéticas enzimáticas in situ e avaliação de alvos terapêuticos. Como resultado desta investigação, foi co-autor de cerca de 50 publicações entre artigos científicos, artigos em conferências científicas e capítulos de livros.

Uma das principais aplicações tem sido o estudo quantitativo de uma importante modificação pós-traducional de proteínas: a glicação. Esta modificação, outrora considerada inespecífica e fora do controlo celular, tem vindo a ser recentemente reconhecida como tendo um papel importante na regulação de processos celulares, modulando a interação entre proteínas e regulando a sua atividade. A investigação das vias envolvidas no catabolismo de agentes glicantes, por abordagens de biologia estrutural e de biologia de sistemas, tem sido um tema recorrente em grande parte das publicações e também o tópico da tese de doutoramento. Embora inicialmente em levedura como modelo biológico, estas linhas de investigação evoluiram para um estudo do metabolismo do metilglioxal e glicação no parasita Leishmania infantum.

Um interesse recente, tem sido a metabolómica baseada em espectrometria de massa de alta resolução.

O desenvolvimento de software científico tem também sido importante na sua atividade científica: A. Ferreira é o autor do programa PLAS (Power Law Analysis and Simulation), orientado para a análise de modelos de redes biológicas baseados em equações diferenciais ordinárias. Recentemente, com o foco no desenvolvimento de métodos de delineamento experimental em cinética enzimática baseada em curvas de progressão, A. Ferreira tem desenvolvido software no “ecossistema” da linguagem Python para computação científica, como alternativa a plataforma comerciais.,

De entre muitas outras, A. Ferreira tem lecionado na FCUL, disciplinas com conteúdos de biologia de sistemas computacional e de programação, das quais se destaca “Bioquímica computacional” e “Simulação Bioquímica”.

Biologia de sistemas computacional. Metabolómica. Análise de dados em metabolómica. Glicação. Enzimologia.

Computational systems biology. Metabolomics. Metabolomics data Analysis. Glication. Enziymology.