Equipa do DI vence competição internacional em "Ontology Matching"

OAEI
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Uma equipa do Departamento de Informática (DI) de Ciências vence competição internacional em correspondência de ontologias.

O Ontology Alignment Evaluation Initiative (OAEI) é uma competição internacional, iniciada em 2005, e que visa avaliar ferramentas de emparelhamento de ontologias.

O projeto SOMER, aprovado em 2012 e financiado pela Fundação para a Ciência e a Tecnologia, possibilitou o desenvolvimento do sistema AML - AgreementMakerLight -, derivado do AgreementMaker, uma plataforma amplamente utilizada em emparelhamento de ontologias desenvolvido pelos colaboradores do Laboratório de Isabel F. Cruz.

Nos últimos anos, a equipa do LASIGE tem desenvolvido aplicações que exploram os dados e conhecimento contido em ontologias. Este grupo especializou-se em prospeção de texto biomédico e medidas de semelhança semântica.

No âmbito do projeto SOMER, o grupo de Ciências, coordenado elo professor do DI, Francisco M. Couto, participou no OAEI 2013 e no OAEI 2014, tendo alcançado este ano o primeiro lugar em todas as tarefas para as quais o AML tinha sido desenvolvido.

Existe também uma colaboração com a Janssen Pharmaceutical Companies of Johnson & Johnson que ficou muito agradada com a possibilidade de usar o AML na gestão dos seus dados. Neste Momento o AML está também a ser explorado para um projeto no âmbito da Food and Agriculture Organization of the United Nations.

“A equipa desenvolveu o sistema AML para competir em seis tarefas (das nove no total), e em todas essas seis ficou em 1.º lugar! Um agradecimento especial ao Daniel Faria por ter passado todo o agosto nisto e a toda a equipa de Ciências envolvida - Cátia Pesquita, Emanuel Santos e Catarina Martins, sem esquecer todo o apoio da equipa de Isabel Cruz, professora da Universidade de Illinois, em Chicago.”
Francisco M. Couto

 

Sobre a perfomance AML

"AML was a step ahead and obtained the best average Recall and F-Measure, and the second best average Precision."

"The biggest improvement in F-measure, as well as the best overall result is achieved by AML, which increases its F-measure by seven percentage points."

"AML* has a better F-Measure than any other system before (4% increase compared to the best matcher of last year)."

"Same as the last year, the AML system set the top result for the anatomy track by improving the result from the last year."

"AML has similar results both in terms of precision and recall and outperforms the other systems in terms of F-measure (for both cases)."

"Tools are ordered according to their highest average F1-measure." (AML in the 1st place).

Notícia atualizada a 27/10/2014

DI com GCIC

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Doutoramento e Mestrado em Ciência Cognitiva 

6ª Edição, 2014-15

A revista mais prestigiada na área da Biologia Computacional publicou um artigo que resulta de uma investigação financiada pela Fundação para a Ciência e a Tecnologia e que inclui investigadores de Ciências e da Universidade de Harvard.

O Centro de Investigação Operacional vai realizar no dia 21 de maio, pelas 14h30, na sala 6.4.30 um seminário intitulado Formulations and Exact&nbs

O Centro de Estatística e Aplicações da Universidade de Lisboa vai organizar de 4 a 6 de Junho de 2014 um curso intitulado "On Flexible Bayesian Methods for Diagnosis and ROC Curve Estimation".

Conferência no dia 21 de Maio, pelas 16h00, sala 6.2.56, Edifício C6, FCUL, Campo Grande, Lisboa.

Dia: 22 de Maio (Dia Internacional da Biodiversidade)

Apesar de já existir há dois anos e meio, e como há sempre novos funcionários/Docentes a entrar, vimos por este meio divulgar mais uma vez o Sistema de Impressão FCUL para funcionários/Docentes da FCUL.

Dinâmica da Actividade Cerebral -

Perspectivas e oportunidades num dos grandes problemas científicos deste século

Medalha internacional de História das Ciências, Marta Lourenço

Ana Eiró, Fernando Bragança Gil, Maria Alzira Ferreira, Luís Mendes Vítor, Virgílio Meira Soares, Fernando Catarino, Fernando Parente, Noémio Marques, Galopim de Carvalho, são algumas das individualidades de Ciências que Marta Lourenço recorda, em jeito de agradecimento, pelos ensinamentos transmitidos.

A iniciativa existe desde 2008. “Um pequeno Roteiro pela Energia Solar Fotovoltaica na Faculdade de Ciências” inclui visitas guiadas ao Campus Solar e à central de mini geração fotovoltaica nos telhados da Faculdade de Ciências, e ainda a palestra “A revolução solar vem aí!”, proferida pelo professor António Vallêra.

“Os ensinamentos adquiridos em Ciências estão na base das investigações que tenho desenvolvido, foi através deles que adquiri os conceitos e conhecimentos que me permitem desenvolver o estudo dos materiais. Por outro lado, a interação com diferentes áreas da Geologia permite absorver muita informação importante para a interpretação de muitos dos achados”, explica a investigadora Elisabete Malafaia.

Jean-Paul Montagner, Institut de Physique du Globe, Université Paris-Diderot, Paris, France

António Castelo, Aidnature

"Recordo-me sobretudo dos professores e da matéria que dava nas aulas. A minha pancada com evolução é forte e já nessa altura era. Ainda hoje nada me dá mais prazer do que aprender e compreender como funciona a vida na terra. Tive muito bons professores durante o curso e isso foi fundamental até quando, mais tarde, saí para fazer o mestrado em Inglaterra", conta o antigo aluno de Biologia de Ciências, António Castelo.

Expedição Aidnature

“Cada animal, cada comportamento é um desafio. O momento em que conseguimos a imagem de que estamos à espera e que imaginámos na nossa cabeça, é de uma adrenalina enorme, que contrasta com a paz que é estar horas no campo à espera”, declara António Castelo, antigo aluno do curso de Biologia de Ciências, agora biólogo na Aidnature.

 Nos dias 29 e 31 de outubro de 2014 realiza-se uma reunião em Heildelberg, na Alemanha, com o intuito de apresentar os 106 novos membros ao EMBO Council.

Ano Internacional da Cristalografia 2014

O Departamento de Geologia da Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa associa-se à comemoração do Ano Internacional da Cristalografia.

MATEMÁTICA E ENSINO

De acordo com o Despacho do Senhor Diretor da Faculdade, a eleição do Presidente do Departamento de Matemática terá lugar no próximo dia 30 de Maio.

Conferência no dia 16 de Maio, 11h30, anfiteatro 3.2.15, Edifício C3, FCUL, Campo Grande, Lisboa.

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