Margarida Carvalho

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Departamento de Química e Bioquímica


Email mhcarvalho@ciencias.ulisboa.pt

Carreira Docente Universitário
Categoria Professor Auxiliar

Indicadores

ResearcherID
Orcid

Currículo Resumido

Formação Académica

1994 Licenciatura em Biologia, FCULisboa

2000 Provas de Aptidão Pedagógica e Capacidade Científica (Biologia Molecular e Celular), FMULisboa

2003 Doutoramento em Ciências Biomédicas (Biologia Molecular e Celular), FMULisboa;

2004 Pós-doutoramento em Biologia Molecular, Dana Farber Cancer Institute/Harvard Medical School, MA, USA

Posição atual

2011 Professora Auxiliar, FC ULisboa

2015 Coordenadora da Unidade Gene Expression and Regulation, BioISI, ULisboa

2015 Lider do grupo RNA Biology and Bioinformatics, BioISI, ULisboa

2015 Coordenadora do Grupo de trabalho de Communication and Outreach, BioISI, ULisboa

Posições anteriores

2016 Visiting assistant Professor (in sabatical leave) Department of Cell Biology, Harvard Medical School, MA, USA

2009-14 Coordenadora de Unidade Gene Expression and Bioinformatics, BioFIG, FCUL

2009-14 Líder de Grupo RNA Biology and Bioinformatics, BioFIG, FCUL

2003-11 Professora Auxiliar, FMUL

2003-04 Visiting researcher, Dana Farber Cancer Institute/Harvard Medical School, MA, USA

2000-03 Assistente, FMUL

1996-00 Assistente Estagiária, FMUL

1995-96 Bolseira de Investigação Científica do Programa Praxis XXI, FMUL

Prémios e bolsas

1º Prémio L’Oreal Portugal/Unesco for Women in Science (2004).

Human Frontiers Science Program Fellowship (2003); Bolsa de curta duração da Fundação Calouste Gulbenkian (2003).


Interesses Científicos

Estudo das redes de regulação pós-transcricional da expressão génica dependentes de RNA e proteínas de ligação ao RNA em vertebrados através de abordagens de biologia molecular, transcritómica e bioinformática, com ênfase no sistema imunitário e nervoso; biogénese de regulação dependente de microRNAs e mecanismos de regulação do splicing, estabilidade e tradução do mRNA; caracterização de perfis de expressão génica por metodologias de larga escala e análise bioinformática; desenvolvimento de estratégias terapêuticas baseadas no controlo de expressão génica e aplicações de sequenciação de nova geração; mecanismos de doenças associados ao metabolismo de RNA, com ênfase em doenças neurodegenerativas.Interações patogénico-hospedeiro, com foco no HIV.


Scientific Interests

Role of post-transcriptional regulatory networks established by RNA binding proteins and microRNAs in the control of gene expression in vertebrates, using molecular biology, transcriptomics and bioinformatic approaches, with an emphasis on the immune and nervous systems; microRNA biogenesis and regulatory processes; mechanisms of splicing regulation, mRNA stability and translational control; characterization of gene expression profiles using massive parallel sequencing approaches and bioinformatics; development of novel therapeutic strategies based on the control of gene expression; mechanisms of disease associated to RNA metabolism, with emphasis on neurodegenerative disorders; host-pathogen interactions, focusing on HIV.


Publicações selecionadas
  • Amaral AJ, Andrade J, Foxall RB, Matoso P, Matos AM, Soares RS, Rocha C, Ramos CG, Tendeiro R, Serra-Caetano A, Guerra-Assunção JA, Santa-Marta M, Gonçalves J, Gama-Carvalho M, Sousa AE (2017). miRNA profiling of human naive CD4 T cells links miR-34c-5p to cell activation and HIV replication. EMBO J. 2017 Feb 1;36(3):346-360.
  • Gama-Carvalho M, Garcia-Vaquero ML, Pinto FR, Besse F, Weis J, Voigt A, Schulz JB, De Las Rivas J (2017) Linking Amyotrophic Lateral Sclerosis and Spinal Muscular Atrophy through RNA-transcriptome homeostasis: a genomics perspective. J. Neurochem. 2017 141(1):12-30.
  • Amaral, A. J., Brito, F. F., Chobanyan, T., Yoshikawa, S., Yokokura, T., Van Vactor, D., & Gama-Carvalho, M. (2014). Quality assessment and control of tissue specific RNA-seq libraries of Drosophila transgenic RNAi models. Frontiers in Genetics, 5. doi: 10.3389/fgene.2014.00043
  • Bras-Rosario, L., Matsuda, A., Pinheiro, A. I., Gardner, R., Lopes, T., Amaral, A., & Gama-Carvalho, M. (2013). Expression Profile of microRNAs Regulating Proliferation and Differentiation in Mouse Adult Cardiac Stem Cells. PloS One, 8(5), e63041. 10.1371/journal.pone.0063041
  • Figueiredo N, Chora A, Raquel H, Pejanovic N, Pereira P, Hartleben B, Neves-Costa A, Moita C, Pedroso D, Pinto A, Marques S, Faridi H, Costa P, Gozzelino R, Zhao JL, Soares MP, Gama-Carvalho M, Martinez J, Zhang Q, Döring G, Grompe M, Simas JP, Huber TB, Baltimore D, Gupta V, Green DR, Ferreira JA and Moita LF (2013). Anthracyclines Induce DNA Damage Response-Mediated Protection against Severe Sepsis. Immunity, 39(5), 874–884.

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