- Rastreamento de alto conteúdo, Microscopia de alto rendimento, Análise de bioimagens, Gestão de infraestruturas de investigação, Fibrose quística, CFTR, Ciência de dados, Tráfego secretório
HUGO BOTELHO
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Carreira Investigação
Categoria Investigador FCT nível inicial
Indicadores
ResearcherIDOrcid
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Palavras Chave
Keywords
- High Content Screening, High Throughput Microscopy, Bioimage analysis, Facility Management, Cystic Fibrosis, CFTR, Data Science, Secretory traffic
Os meus interesses de investigação são a identificação e a caracterização de proteínas ou pequenas moléculas que regulam o tráfego da proteína CFTR, que é a responsável pela doença Fibrose Quística (FQ). Utilizando ferramentas cellulares, bioquímicas e de biologia molecular pretendo contribuir para o desenvolvimento de novos e eficientes fármacos para os indivíduos com FQ. Estou atualmente a efetuar um rastreamento de alto conteúdo baseado em siRNAs a uma escala quase genómica utilizando modelos celulares de FQ para descobrir e caracterizar genes cuja inibição pode potencialmente conduzir a benefícios clínicos para os indivíduos com FQ. Estou também interessado no desenvolvimento de ensaios de microscopia de alto rendimento e de rotinas de análise automática de imagem (ImageJ, CellProfiler) e produtos de ciência de dados (R, Python) para a visualização, controlo de qualidade e normalização de dados provenientes de rastreamento de alto rendimento (http://github.com/hmbotelho).
My research interests are the identification and characterization of proteins and small molecules which regulate the traffic of the CFTR protein, which is responsible for Cystic Fibrosis. Using cell, biochemical and molecular biology tools I aim at contributing to the development of novel and effective therapeutic drugs for CF patients. I am currently performing a high content siRNA-based screening campaign at near genomic scale using CF cellular models to uncover and characterize genes which can be inhibited to achieve potential clinical benefits for CF patients. I am also interested in the development of high-throughput microscopy screening assays, automated image analysis routines (ImageJ, CellProfiler) and data science products (R, Python) for data visualization, quality control and data normalization in high-throughput screening datasets (http://github.com/hmbotelho).
- Hagemeijer MC, Vonk AM, Awatade NT, Silva IAL, Tischer C, Hilsenstein V, Beekman JM, Amaral MD, Botelho HM (2021) AN OPEN-SOURCE HIGH-CONTENT ANALYSIS WORKFLOW FOR CFTR FUNCTION MEASUREMENTS USING THE FORSKOLIN-INDUCED SWELLING ASSAY. Bioinformatics, 36(24): 5686-5694
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