HUGO BOTELHO

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Departamento de Química e Bioquímica

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Carreira Investigação

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Interesses Científicos

Os meus interesses de investigação são a identificação e a caracterização de proteínas ou pequenas moléculas que regulam o tráfego da proteína CFTR, que é a responsável pela doença Fibrose Quística (FQ). Utilizando ferramentas cellulares, bioquímicas e de biologia molecular pretendo contribuir para o desenvolvimento de novos e eficientes fármacos para os indivíduos com FQ. Estou atualmente a efetuar um rastreamento de alto conteúdo baseado em siRNAs a uma escala quase genómica utilizando modelos celulares de FQ para descobrir e caracterizar genes cuja inibição pode potencialmente conduzir a benefícios clínicos para os indivíduos com FQ.

Estou também interessado no desenvolvimento de ensaios de microscopia de alto rendimento e de rotinas de análise automática de imagem (ImageJ, CellProfiler) e produtos de ciência de dados (R, Python) para a visualização, controlo de qualidade e normalização de dados provenientes de rastreamento de alto rendimento (http://github.com/hmbotelho).


Scientific Interests

My research interests are the identification and characterization of proteins and small molecules which regulate the traffic of the CFTR protein, which is responsible for Cystic Fibrosis. Using cell, biochemical and molecular biology tools I aim at contributing to the development of novel and effective therapeutic drugs for CF patients. I am currently performing a high content siRNA-based screening campaign at near genomic scale using CF cellular models to uncover and characterize genes which can be inhibited to achieve potential clinical benefits for CF patients.

I am also interested in the development of high-throughput microscopy screening assays, automated image analysis routines (ImageJ, CellProfiler) and data science products (R, Python) for data visualization, quality control and data normalization in high-throughput screening datasets (http://github.com/hmbotelho).


Publicações selecionadas
  • Hagemeijer MC, Vonk AM, Awatade NT, Silva IAL, Tischer C, Hilsenstein V, Beekman JM, Amaral MD, Botelho HM (2021) AN OPEN-SOURCE HIGH-CONTENT ANALYSIS WORKFLOW FOR CFTR FUNCTION MEASUREMENTS USING THE FORSKOLIN-INDUCED SWELLING ASSAY. Bioinformatics, 36(24): 5686-5694
  • Botelho HM, Uliyakina I, Awatade NT, Proença MC, Tischer C, Sirianant L, Kunzelmann K, Pepperkok R, Amaral MD (2015) PROTEIN TRAFFIC DISORDERS: AN EFFECTIVE HIGH-THROUGHPUT FLUORESCENCE MICROSCOPY PIPELINE FOR DRUG DISCOVERY. Sci Rep, 5, 9038
  • Silva IAL, Dousova T, Ramalho S, Centeio R, Clarke LA, Railean V, Botelho HM, Holubová A, Valášková I, Yeh J-T, Hwang T-C, Farinha CM, Kunzelmann K, Amaral MD (2020) ORGANOIDS AS A PERSONALIZED MEDICINE TOOL FOR ULTRA-RARE MUTATIONS IN CYSTIC FIBROSIS: THE CASE OF S955P AND 1717-2A>G. Biochim Biophys Acta – Mol Basis Dis, 1866, 165905
  • Santos JD, Canato S, Carvalho AS, Botelho HM, Aloria K, Amaral MD, Matthiesen R, Falcão AO, Farinha CM (2019) FOLDING STATUS IS DETERMINANT OVER TRAFFIC-COMPETENCE IN DEFINING CFTR INTERACTORS IN THE ENDOPLASMIC RETICULUM. Cells, 8(4): 353
  • Awatade NT, Ramalho S, Silva IAL, Felício V, Botelho HM, de Poel E, Vonk A, Beekman JM, Farinha CM, Amaral MD (2018) R560S: A CLASS II CFTR MUTATION THAT IS NOT RESCUED BY CURRENT MODULATORS. J Cyst Fibros, 18(2):182-189

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