Objetivos da Unidade Curricular

Pretende-se apresentar uma introdução à Genética da Conservação, a disciplina que aplica princípios e práticas da genética na conservação e gestão das espécies e do seu potencial evolutivo. O curso inclui o ensino de conceitos teóricos fundamentais e de ferramentas analíticas para estudos genéticos no âmbito da Biologia da Conservação.

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Pré-requisitos

Sem pré-requisitos

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Conteúdos

- Definição, objectivos e âmbito da Genética da Conservação.

- Diversidade genética, vulnerabilidade das populações e conservação dos processos evolutivos.

- Unidades de Conservação e medidas de gestão das populações.

- Marcadores moleculares. Adaptação. Genómica da Conservação.

- Genética das populações. Estrutura genética populacional.

- Filogenias. Filogeografia.

- Linhagens genealógicas e teoria da coalescência. Tamanho efetivo populacional e história demográfica.

- Exemplos e casos de estudo.

- Programas informáticos para análise de dados em Genética da Conservação.

 

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Descrição detalhada dos conteúdos programáticos

Componente Teórica-Prática

Âmbito da Genética da Conservação.

Marcadores moleculares mais utilizados. DNA mitocondrial e microssatélites. Sequenciação de "nova geração".

Medidas de variabilidade e diferenciação das populações.

Definição de Unidades de Conservação e translocações.

Genómica da conservação. Adaptação - detecção, genes candidatos e estudos de expressão.

Genética populacional – Bases para a compreensão dos outputs dos softwares a usar. Análise de dados genéticos em genética populacional.

Programas – GENEPOP e ARLEQUIN (medidas de variabilidade e diferenciação); STRUCTURE (análise da estrutura genética).

Bases de dados de sequências. Procura de sequências em bases de dados. Alinhamento de sequências.

Desenho de primers - utilização do programa Primer3.

Filogenias e Filogeografia. Métodos de reconstrução de árvores filogenéticas e de redes de haplótipos. Programas MEGA, PHYML e NETWORK

Noção de coalescência. Influencia da historia demográfica nos padrões genéticos. Programas – ARLEQUIN e DNAsp (padrões de distribuição mismatch e testes de neutralidade), BOTTLENECK (mudanças no tamanho da população).

Todos os métodos são discutidos com base em exemplos nos quais dados genéticos são usados para responder a questões da biologia da

conservação.

Os alunos apresentam um seminário.

 

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Bibliografia

Recomendada

Frankham,R.; Ballou, J.D. & Briscoe, D. A. (2002) - Introduction to conservation Genetics. Cambridge University Press.

Allendorf, F & Luikart G (2006) Conservation and the Genetics of Populations. Blackwell Publishing.

Artigos (originais e de revisão) de revistas, particularmente da “Conservation Genetics”, “Molecular Ecology”, “Conservation Biology”, “Animal Conservation” e “Biological Conservation”.Beebee, T & Rowe, G. (2004) – An introduction to molecular ecology. Oxford University Press. New York.

 

Outros elementos de estudo

Frankham,R.; Ballou, J.D. & Briscoe, D. A. (2002) - Introduction to conservation Genetics. Cambridge University Press.

Allendorf, F & Luikart G (2006) Conservation and the Genetics of Populations. Blackwell Publishing.

Papers (original investigations and review papers), particularly from the journals “Conservation Genetics”, “Molecular Ecology”, “Conservation Biology”, “Animal Conservation” and “Biological Conservation”.

 

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Métodos de Ensino

Na apresentação dos conteúdos serão utilizados métodos audiovisuais que estimulem a participação dos alunos e em discussões que estimulem o sentido crítico. Uma parte importante das aulas inclui a formação prática em programas de análise genética com relevo em biologia de conservação. Os conteúdos da disciplina são colocados na plataforma Moodle.

 

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Métodos de Avaliação

Exame teórico-prático – 80 % (16 valores)

Seminário (grupo) – 15% (3 valores)

Participação nas aulas – 5% (1 valor)

 

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Língua de ensino

Português.