Objetivos da Unidade Curricular

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Pré-requisitos

Sem pré-requisitos

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Conteúdos

 

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Descrição detalhada dos conteúdos programáticos

Componente Teórica

Pretende-se com esta disciplina cobrir os aspectos fundamentais da bioinformática, focando-a nas suas aplicações na área das ciências da saúde. Assim são dados conhecimentos respeitantess às especificidades da bioinformática na análise de sequências biológicas, cobrindo os métodos de procura e alinhamento de sequências, visualização de informação e uso de repositórios de dados e serviços para realizar as operações mais comuns em bioinformática. São também introduzidos tópicos para prospecção de literatura biomédica e recuperação de anotações para compostos biológicos. Finalmente os tópicos anteriores são integrados, abordando aspectos centrais à gestão de dados clínicos numa perspectiva da medicina personalizada 

 

Componente Teórica-Prática

Os alunos recebem formação nas áreas da programação na linguagem Python e nos seus usos para processamento de informação biológica. Aspectos cobertos são: fundamentos de programação imperativa, estruturas e tipos de dados em Python, estruturas de controlo de fluxo, introdução a programação orientada a objectos em Python, uso de bibliotecas específicas para processamento de informação biológica (BioPython)

 

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Bibliografia

Recomendada

Lesk, AM. 2008. Introduction to Bioinformatics. 3rd edition. Oxford University Press. ISBN: 978-0-19-920804-3

Orengo CA, Jones DT, Thornton JM. 2003. Bioinformatics - Genes Proteins and Computers. BIOS. ISBN:1-85996-054-5

Biomedical Informatics: Computer Applications in Health Care and Biomedicine, Edward H Shortliffe and James J. Cimino, Springer, ISBN: 978-0-38728986-1.

 

Outros elementos de estudo

Transparências das aulas teóricas e teóricas e práticas dos docentes

 

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Métodos de Ensino

Ensino presencial com exposição oral nas aulas teóricas. Resolução de problemas concretos e exercícios nas aulas teórico-Práticas

 

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Métodos de Avaliação

Exame final e Projecto da disciplina com avaliação em grupo

 

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Língua de ensino

Português. Os elementos de estudo são em Inglês