Bioinformática LCS
Ano Letivo: 2015/16
Departamento: Informática
Carga horária:
Área Científica:
Objetivos da Unidade Curricular
Pré-requisitos
Sem pré-requisitosConteúdos
Descrição detalhada dos conteúdos programáticos
Componente Teórica
Pretende-se com esta disciplina cobrir os aspectos fundamentais da bioinformática, focando-a nas suas aplicações na área das ciências da saúde. Assim são dados conhecimentos respeitantess às especificidades da bioinformática na análise de sequências biológicas, cobrindo os métodos de procura e alinhamento de sequências, visualização de informação e uso de repositórios de dados e serviços para realizar as operações mais comuns em bioinformática. São também introduzidos tópicos para prospecção de literatura biomédica e recuperação de anotações para compostos biológicos. Finalmente os tópicos anteriores são integrados, abordando aspectos centrais à gestão de dados clínicos numa perspectiva da medicina personalizada
Componente Teórica-Prática
Os alunos recebem formação nas áreas da programação na linguagem Python e nos seus usos para processamento de informação biológica. Aspectos cobertos são: fundamentos de programação imperativa, estruturas e tipos de dados em Python, estruturas de controlo de fluxo, introdução a programação orientada a objectos em Python, uso de bibliotecas específicas para processamento de informação biológica (BioPython)
Bibliografia
Recomendada
Lesk, AM. 2008. Introduction to Bioinformatics. 3rd edition. Oxford University Press. ISBN: 978-0-19-920804-3
Orengo CA, Jones DT, Thornton JM. 2003. Bioinformatics - Genes Proteins and Computers. BIOS. ISBN:1-85996-054-5
Biomedical Informatics: Computer Applications in Health Care and Biomedicine, Edward H Shortliffe and James J. Cimino, Springer, ISBN: 978-0-38728986-1.
Outros elementos de estudo
Transparências das aulas teóricas e teóricas e práticas dos docentes
Métodos de Ensino
Ensino presencial com exposição oral nas aulas teóricas. Resolução de problemas concretos e exercícios nas aulas teórico-Práticas
Métodos de Avaliação
Exame final e Projecto da disciplina com avaliação em grupo
Língua de ensino
Português. Os elementos de estudo são em Inglês